Finn Kvist Vogensen

2019

A comparative genomics approach for identifying host-range determinants in Streptococcus thermophilus bacteriophages

Szymczak, P., Rau, M. H., Monteiro, J. M., Pinho, M. G., Filipe, S. R., Vogensen, F. K., Zeidan, A. A. & Janzen, T., 1 dec. 2019, I: Scientific Reports. 9, 14 s., 7991.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

10 Citationer (Scopus)

31 Downloads (Pure)

Isolation and characterization of bacteriophages active against methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius

Moodley, A., Kot, W., Nälgård, S., Jakociune, D., Neve, H., Hansen, L. H., Guardabassi, L. & Vogensen, F. K., 2019, I: Research in Veterinary Science. 122, s. 81-85 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

9 Citationer (Scopus)

Mouse vendor influence on the bacterial and viral gut composition exceeds the effect of diet

Rasmussen, T. S., de Vries, L., Kot, W., Hansen, L. H., Castro-Mejía, J. L., Vogensen, F. K., Hansen, A. K. & Nielsen, D. S., 2019, I: Viruses. 11, 5, 15 s., 435.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

21 Citationer (Scopus)

21 Downloads (Pure)

Novel isolates of Streptococcus thermophilus bacteriophages from group 5093 identified with an improved multiplex PCR typing method

Szymczak, P., Vogensen, F. K. & Janzen, T., 2019, I: International Dairy Journal. 91, s. 18-24 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

56 Downloads (Pure)

2018

Cell Wall Glycans Mediate Recognition of the Dairy Bacterium Streptococcus thermophilus by Bacteriophages

Szymczak, P., Filipe, S. R., Covas, G., Vogensen, F. K., Neves, A. R. & Janzen, T., 1 dec. 2018, I: Applied and Environmental Microbiology. 84, 23, s. 1-15 e01847-18.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

Extraction and purification of viruses from fecal samples for metagenome and morphology analyses

Castro-Mejía, J. L., Deng, L., Vogensen, F. K., Reyes, A. & Nielsen, D. S., 2018, The Human Virome: Methods and Protocols. Moya, A. & Brocal, V. P. (red.). Humana Press, s. 49-57 9 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1838).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

3 Citationer (Scopus)

Gut microbiota recovery and immune response in ampicillin-treated mice

Castro Mejia, J. L., Jakesevic, M., Fabricius, N. F., Krych, L., Nielsen, D. S., Kot, W., Bendtsen, K. M. B., Vogensen, F. K., Hansen, C. H. F. & Hansen, A. K., jun. 2018, I: Research in Veterinary Science. 118, s. 357-364 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

Have you tried spermine? A rapid and cost-effective method to eliminate dextran sodium sulfate inhibition of PCR and RT-PCR

Krych, L., Kot, W., Bendtsen, K. M. B., Hansen, A. K., Vogensen, F. K. & Nielsen, D. S., jan. 2018, I: Journal of Microbiological Methods. 144, s. 1-7 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

33 Citationer (Scopus)

Investigation of the bacteriophage community in induced lysates of undefined mesophilic mixed-strain DL-cultures using classical and metagenomic approaches

Muhammed, M. K., Olsen, M. L., Kot, W. P., Neve, H., Castro Mejia, J. L., Janzen, T., Hansen, L. H., Nielsen, D. S., Sørensen, S. J., Heller, K. J. & Vogensen, F. K., 2 maj 2018, I: International Journal of Food Microbiology. 272, s. 61-72 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

2017

A high-throughput qPCR system for simultaneous quantitative detection of dairy Lactococcus lactis and Leuconostoc bacteriophages

Muhammed, M. K., Krych, L., Nielsen, D. S. & Vogensen, F. K., 2017, I: PLOS ONE. 12, 3, 12 s., e0174223.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

12 Citationer (Scopus)

94 Downloads (Pure)

Genomic Characterization of Dairy Associated Leuconostoc Species and Diversity of Leuconostocs in Undefined Mixed Mesophilic Starter Cultures

Frantzen, C. A., Kot, W., Pedersen, T. B., Ardö, Y. M., Broadbent, J. R., Neve, H., Hansen, L. H., Dal Bello, F., Ostlie, H. M., Kleppen, H. P., Vogensen, F. K. & Holo, H., 3 feb. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

21 Citationer (Scopus)

86 Downloads (Pure)

Immunological effects of reduced mucosal integrity in the early life of BALB/c mice

Bendtsen, K. M. B., Hansen, C. H. F., Krych, L., Skovgaard, K., Kot, W. P., Vogensen, F. K. & Hansen, A. K., maj 2017, I: PLOS ONE. 12, 5, 20 s., 0176662.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

11 Citationer (Scopus)

151 Downloads (Pure)

Metagenomic analysis of dairy bacteriophages: extraction method and pilot study on whey samples derived from using undefined and defined mesophilic starter cultures

Muhammed, M. K., Kot, W. P., Neve, H., Mahony, J., Castro Mejia, J. L., Krych, L., Hansen, L. H., Nielsen, D. S., Sørensen, S. J., Heller, K. J., van Sinderen, D. & Vogensen, F. K., 2017, I: Applied and Environmental Microbiology. 83, 19, 15 s., e00888-17.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

9 Citationer (Scopus)

Novel Variants of Streptococcus thermophilus Bacteriophages Are Indicative of Genetic Recombination among Phages from Different Bacterial Species

Szymczak, P., Janzen, T., Neves, A. R., Kot, W., Hansen, L. H., Lametsch, R., Neve, H., Franz, C. M. A. P. & Vogensen, F. K., 2017, I: Applied and Environmental Microbiology. 85, 5, 16 s., e02748-16.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

17 Citationer (Scopus)

61 Downloads (Pure)

Traditional Fermented Dairy Products of Ethiopia: A Review

Berhe, T., Vogensen, F. K., Ipsen, R., Seifu, E., Kurtu, M. Y. & Hansen, E. B., 2017, I: East African Journal of Sciences. 11, 2, s. 73-80 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

106 Downloads (Pure)

2016

Clear plaque mutants of lactococcal phage TP901-1

Kot, W., Kilstrup, M., Vogensen, F. K. & Hammer, K., jun. 2016, I: P L o S One. 11, 6, 10 s., e0155233.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

140 Downloads (Pure)

Effect of heterofermentative lactic acid bacteria of DL-starters in initial ripening of semi-hard cheese

Pedersen, T. B., Vogensen, F. K. & Ardö, Y. M., 1 jun. 2016, I: International Dairy Journal. 57, s. 72-79 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

9 Citationer (Scopus)

Real-time metabolomic analysis of lactic acid bacteria as monitored by in vitro NMR and chemometrics

Ebrahimi, P., Larsen, F. H., Jensen, H. M., Vogensen, F. K. & Engelsen, S. B., 1 apr. 2016, I: Metabolomics. 12, 4, 17 s., 77.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

14 Citationer (Scopus)

Taxonomy of prokaryotic viruses: update from the ICTV bacterial and archaeal viruses subcommittee

Krupovic, M., Dutilh, B. E., Adriaenssens, E. M., Wittmann, J., Vogensen, F. K., Sullivan, M. B., Rumnieks, J., Prangishvili, D., Lavigne, R., Kropinski, A. M., Klumpp, J., Gillis, A., Enault, F., Edwards, R. A., Duffy, S., Clokie, M. R. C., Barylski, J., Ackermann, H. W. & Kuhn, J. H., 1 apr. 2016, I: Archives of Virology. 161, 4, s. 1095-1099 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › peer review

56 Citationer (Scopus)

Transcriptome analysis of Lactococcus lactis subsp. lactis during milk acidification as affected by dissolved oxygen and the redox potential

Larsen, N., Moslehi Jenabian, S., Werner, B. B., Lund Jensen, M., Garrigues, C., Vogensen, F. K. & Jespersen, L., 2 jun. 2016, I: International Journal of Food Microbiology. 226, s. 5-12 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

15 Citationer (Scopus)

2015

Classification of Lactococcus lactis cell envelope proteinase based on gene sequencing, peptides formed after hydrolysis of milk, and computer modeling

Børsting, M. W., Qvist, K. B., Brockmann, E., Vindeløv, J., Pedersen, T. L., Vogensen, F. K. & Ardö, Y. M., 2015, I: Journal of Dairy Science. 98, 1, s. 68-77 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

Contribution of volatiles to the antifungal effect of Lactobacillus paracasei in defined medium and yogurt

Aunsbjerg, S. D., Honoré, A. H., Marcussen, J., Ebrahimi, P., Vogensen, F. K., Benfeldt, C., Skov, T. & Knøchel, S., 2 feb. 2015, I: International Journal of Food Microbiology. 194, s. 46-53 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

34 Citationer (Scopus)

Development of a chemically defined medium for studying foodborne bacterial-fungal interactions

Aunsbjerg, S. D., Honoré, A. H., Vogensen, F. K. & Knøchel, S., 2015, I: International Dairy Journal. 45, s. 48-55 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

Effect of dissolved oxygen on redox potential and milk acidification by lactic acid bacteria isolated from a DL-starter culture

Larsen, N., Werner, B. B., Vogensen, F. K. & Jespersen, L., 1 mar. 2015, I: Journal of Dairy Science. 98, 3, s. 1640-1651 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

14 Citationer (Scopus)

Influence of proteolytic Lactococcus lactis subsp. cremoris on ripening of reduced-fat Cheddar cheese made with camel chymosin

Børsting, M. W., Stallknecht, M. K., Vogensen, F. K. & Ardö, Y. M., 1 feb. 2015, I: International Dairy Journal. 41, s. 38-45 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

Optimizing protocols for extraction of bacteriophages prior to metagenomic analyses of phage communities in the human gut

Castro Mejia, J. L., Muhammed, M. K., Kot, W. P., Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, L. H., Vogensen, F. K. & Nielsen, D. S., 17 nov. 2015, I: Microbiome. 3, 14 s., 64.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

62 Citationer (Scopus)

466 Downloads (Pure)

Phytase-active lactic acid bacteria from sourdoughs: isolation and identification

Nuobariene, L., Cizeikiene, D., Gradzeviciute, E., Hansen, Å. S., Rasmussen, S. K., Juodeikiene, G. & Vogensen, F. K., 2015, I: Lebensmittel - Wissenschaft und Technologie. 63, 1, s. 766-772 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

31 Citationer (Scopus)

Role of volatiles in antifungal activity of a Lactobacillus paracasei against Penicillium strains

Aunsbjerg, S. D., Honoré, A. H., Ebrahimi, P., Vogensen, F. K., Skov, T. & Knøchel, S., 2015. 1 s.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

17 Downloads (Pure)

2014

Bacteriophages of Leuconostoc, Oenococcus, and Weissella

Kot, W., Neve, H., Heller, K. J. & Vogensen, F. K., 2014, I: Frontiers in Microbiology. 5, s. 1-9 9 s., 186.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

35 Citationer (Scopus)

1323 Downloads (Pure)

Characterization of the gut microbiota in leptin deficient obese mice: correlation to inflammatory and diabetic parameters

Ellekilde, M., Krych, L., Hansen, C. H. F., Hufeldt, M. R., Dahl, K., Hansen, L. H., Sørensen, S. J., Vogensen, F. K., Nielsen, D. S. & Hansen, A. K., apr. 2014, I: Research in Veterinary Science. 96, 2, s. 241-250 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

49 Citationer (Scopus)

Complete genome sequences of four novel Lactococcus lactis phages distantly related to the Rare 1706 Phage Species

Kot, W. P., Neve, H., Vogensen, F. K., Heller, K. J., Sørensen, S. J. & Hansen, L. H., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00265-14.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

4 Citationer (Scopus)

1024 Downloads (Pure)

DPS - a rapid method for genome sequencing of DNA-containing bacteriophages directly from a single plaque

Kot, W. P., Vogensen, F. K., Sørensen, S. J. & Hansen, L. H., feb. 2014, I: Journal of Virological Methods. 196, s. 152-156 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

25 Citationer (Scopus)

Genome sequence of Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris strain T26, isolated from mesophilic undefined cheese starter

Pedersen, T. B., Kot, W. P., Hansen, L. H., Sørensen, S. J., Broadbent, J. R., Vogensen, F. K. & Ardö, Y. M., 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

1166 Downloads (Pure)

Genome sequences of two Leuconostoc pseudomesenteroides strains isolated from Danish dairy starter cultures

Pedersen, T. B., Kot, W. P., Hansen, L. H., Sørensen, S. J., Broadbent, J. R., Vogensen, F. K. & Ardö, Y. M., 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, s. 2 e00484-14.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

874 Downloads (Pure)

Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

Kot, W. P., Hansen, L. H., Neve, H., Hammer, K., Jacobsen, S., Pedersen, P. D., Sørensen, S. J., Heller, K. J. & Vogensen, F. K., 17 apr. 2014, I: International Journal of Food Microbiology. 176, s. 29-37 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

14 Citationer (Scopus)

Transfer of gut microbiota from lean and obese mice to antibiotic-treated mice

Ellekilde, M., Selfjord, E. M., Larsen, C. S., Jakesevic, M., Rune, I., Christensen, B. T., Vogensen, F. K., Nielsen, D. S., Bahl, M. I., Licht, T. R., Hansen, A. K. & Hansen, C. H. F., 1 aug. 2014, I: Scientific Reports. 4, 8 s., 5922.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

75 Citationer (Scopus)

132 Downloads (Pure)

2013

2-heptyl-formononetin increases cholesterol and induces hepatic steatosis in mice

Andersen, C., Schjoldager, J. G., Tortzen, C., Vegge, A., Hufeldt, M. R., Skaanild, M. T., Vogensen, F. K., Kristiansen, K., Hansen, A. J. K. & Nielsen, J., 2013, I: Journal of Biomedicine and Biotechnology. 2013, 13 s., 926942.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

2212 Downloads (Pure)

Classification of lytic bacteriophages attacking dairy Leuconostoc starter strains

Ali, Y., Kot, W. P., Atamer, Z., Hinrichs, J., Vogensen, F. K., Heller, K. J. & Neve, H., jun. 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 12, s. 3628-3636 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

24 Citationer (Scopus)

Development and validation of a chemically defined medium used for studying foodborne bacterial-fungal interactions

Nielsen, S. D. A., Honoré, A. H., Vogensen, F. K. & Knøchel, S., 2013. 1 s.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

542 Downloads (Pure)

Effect of Lactobacillus salivarius Ls-33 on fecal microbiota in obese adolescents

Larsen, N., Vogensen, F. K., Gøbel, R. J., Michaelsen, K. F., Forssten, S. D., Lahtinen, S. J. & Jakobsen, M., dec. 2013, I: Clinical Nutrition. 32, 6, s. 935-940 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

45 Citationer (Scopus)

Growth of adjunct Lactobacillus casei in Cheddar cheese differing in milk fat globule membrane components

Martinovic, A., Moe, K. M., Romeih, E., Aideh, B. Y., Vogensen, F. K., Østlie, H. & Skeie, S., aug. 2013, I: International Dairy Journal. 31, 2, s. 70-82 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

18 Citationer (Scopus)

Identification of the receptor-binding protein in lytic Leuconostoc pseudomesenteroides bacteriophages

Kot, W. P., Hammer, K., Neve, H. & Vogensen, F. K., maj 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 10, s. 3311-3314 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

15 Citationer (Scopus)

Investigation of the relationship between lactococcal host cell wall polysaccharide genotype and 936 phage receptor binding protein phylogeny

Mahony, J., Kot, W. P., Murphy, J., Ainsworth, S., Neve, H., Hansen, L. H., Heller, K. J., Sørensen, S. J., Hammer, K., Cambillau, C., Vogensen, F. K. & Sinderen, D. V., jul. 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 14, s. 4385-4392 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

69 Citationer (Scopus)

Lactobacillus delbrueckii subsp. jakobsenii subsp. nov., isolated from dolo wort, an alcoholic fermented beverage in Burkina Faso

Adimpong, D. B., Nielsen, D. S., Sørensen, K. I., Vogensen, F. K., Sawadogo-Lingani, H., Derkx, P. M. F. & Jespersen, L., okt. 2013, I: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 63, 11, s. 3720-3726 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

18 Citationer (Scopus)

Potential impact on cheese flavour of heterofermentative bacteria from starter cultures

Pedersen, T. B., Ristagno, D., McSweeney, P. L. H., Vogensen, F. K. & Ardö, Y. M., dec. 2013, I: International Dairy Journal. 33, 2, s. 112-119 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

23 Citationer (Scopus)

The lactococcal phages Tuc2009 and TP901-1 incorporate two alternate forms of their tail fiber into their virions for infection specialization

Stockdale, S. R., Mahony, J., Courtin, P., Chapot-Chartier, M.-P., Pijkeren, J.-P. V., Britton, R. A., Neve, H., Heller, K. J., Aideh, B. Y., Vogensen, F. K. & Sinderen, D. V., 22 feb. 2013, I: Journal of Biological Chemistry. 288, 8, s. 5581-5590 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

66 Citationer (Scopus)

2012

Early life treatment with vancomycin propagates Akkermansia muciniphila and reduces diabetes incidence in the NOD mouse

Hansen, C. H. F., Krych, L., Nielsen, D. S., Vogensen, F. K., Hansen, L. H., Sørensen, S. J., Buschard, K. & Hansen, A. J. K., aug. 2012, I: Diabetologia. 55, 8, s. 2285-2294 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

280 Citationer (Scopus)

Faecal and caecal microbiota profiles of mice do not cluster in the same way

Pang, W., Vogensen, F. K., Nielsen, D. S. & Hansen, A. J. K., jul. 2012, I: Laboratory Animals. 46, 3, s. 231-236 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

23 Citationer (Scopus)

Impact of selected coagulants and starters on primary proteolysis and amino acid release related to bitterness and structure of reduced-fat Cheddar cheese

Børsting, M. W., Qvist, K. B., Rasmussen, M., Vindeløv, J., Vogensen, F. K. & Ardö, Y. M., sep. 2012, I: Dairy Science & Technology. 92, 5, s. 593-612 20 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

20 Citationer (Scopus)

Isolation and characterization of antifungal dairy propionibacteria

Min, M., Nielsen, S. D. A., Vogensen, F. K. & Knøchel, S., 2012. 1 s.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

563 Downloads (Pure)

Finn Kvist Vogensen

Publikation

Søgeresultater