Trine Nielsen

2019

Metformin-induced changes of the gut microbiota in healthy young men: results of a non-blinded, one-armed intervention study

Bryrup, T., Thomsen, C. W., Kern, T., Allin, K. H., Brandslund, I., Jørgensen, N. R., Vestergaard, H., Hansen, T., Hansen, T. H., Pedersen, O. & Nielsen, T., jun. 2019, I: Diabetologia. 62, 6, s. 1024-1035

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

43 Citationer (Scopus)

27 Downloads (Pure)

2018

Aberrant intestinal microbiota in individuals with prediabetes

Allin, K. H., Tremaroli, V., Caesar, R., Jensen, B. A. H., Damgaard, M. T. F., Bahl, M. I., Licht, T. R., Hansen, T. H., Nielsen, T., Dantoft, T. M., Linneberg, A., Jørgensen, T., Vestergaard, H., Kristiansen, K., Franks, P. W., IMI-DIRECT consortium, Hansen, T., Bäckhed, G. F. & Pedersen, O. B., 1 apr. 2018, I: Diabetologia. 61, 4, s. 810-820 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

98 Citationer (Scopus)

147 Downloads (Pure)

A computational framework to integrate high-throughput "-omics" datasets for the identification of potential mechanistic links

Pedersen, H. K., Forslund, S. K., Gudmundsdottir, V., Petersen, A. Ø., Hildebrand, F., Hyötyläinen, T., Nielsen, T., Hansen, T., Bork, P., Ehrlich, S. D., Brunak, S., Oresic, M., Pedersen, O. & Nielsen, H. B., 1 dec. 2018, I: Nature Protocols. 13, 12, s. 2781-2800 20 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

21 Citationer (Scopus)

A low-gluten diet induces changes in the intestinal microbiome of healthy Danish adults

Hansen, L. B. S., Roager, H. M., Søndertoft, N. B., Gøbel, R. J., Kristensen, M. B., Vallès-Colomer, M., Vieira-Silva, S., Ibrügger, S., Lind, M. V., Mærkedahl, R. B., Bahl, M. I., Madsen, M. L., Havelund, J., Falony, G., Tetens, I., Nielsen, T., Allin, K. H., Frandsen, H. L., Hartmann, B., Holst, J. J., & 32 flereSparholt, M. H., Holck, J., Blennow, A., Moll, J. M., Meyer, A. S., Hoppe, C., Poulsen, J. H., Carvalho, V., Sagnelli, D., Dalgaard, M. D., Christensen, A. F., Lydolph, M., Ross, A. B., Villas-Bôas, S. G., Brix, S., Sicheritz-Pontén, T., Buschard, K., Linneberg, A. R., Rumessen, J. J., Ekstrøm, C. T., Ritz, C., Kristiansen, K., Nielsen, H. B., Vestergaard, H., Færgeman, N. J., Raes, J., Frøkiær, H., Hansen, T., Lauritzen, L., Gupta, R., Licht, T. R. & Pedersen, O. B., 1 dec. 2018, I: Nature Communications. 9, 13 s., 4630.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

32 Citationer (Scopus)

140 Downloads (Pure)

Gestational diabetes is associated with change in the gut microbiota composition in third trimester of pregnancy and postpartum

Crusell, M. K. W., Hansen, T. H., Nielsen, T., Allin, K. H., Rühlemann, M. C., Damm, P., Vestergaard, H., Rørbye, C., Jørgensen, N. R., Christiansen, O. B., Heinsen, F., Franke, A., Hansen, T., Lauenborg, J. & Pedersen, O., 15 maj 2018, I: Microbiome. 6, 19 s., 89.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

105 Citationer (Scopus)

128 Downloads (Pure)

Impact of a vegan diet on the human salivary microbiota

Hansen, T. H., Kern, T., Bak, E. G., Kashani, A., Allin, K. H., Nielsen, T., Hansen, T. & Pedersen, O., 2018, I: Scientific Reports. 8, s. 1-11 5847.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

35 Citationer (Scopus)

74 Downloads (Pure)

Population-based studies of relationships between dietary acidity load, insulin resistance and incident diabetes in Danes 11 Medical and Health Sciences 1103 Clinical Sciences

Gæde, J., Nielsen, T., Madsen, M. L., Toft, U., Jørgensen, T., Overvad, K., Tjønneland, A., Hansen, T., Allin, K. H. & Pedersen, O., 6 okt. 2018, I: Nutrition Journal. 17, 1, 91.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

Recovery of gut microbiota of healthy adults following antibiotic exposure

Palleja, A., Mikkelsen, K. H., Forslund, S. K., Kashani, A., Allin, K. H., Nielsen, T., Hansen, T. H., Liang, S., Feng, Q., Zhang, C., Pyl, P. T., Coelho, L. P., Yang, H., Wang, J., Typas, A., Nielsen, M. F., Nielsen, H. B., Bork, P., Wang, J., Vilsbøll, T., & 4 flereHansen, T., Knop, F. K., Arumugam, M. & Pedersen, O., 1 nov. 2018, I: Nature Microbiology. 3, 11, s. 1255-1265 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

143 Citationer (Scopus)

2017

Corrigendum: Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

Forslund, K., Hildebrand, F., Nielsen, T., Falony, G., Le Chatelier, E., Sunagawa, S., Prifti, E., Vieira-Silva, S., Gudmundsdottir, V., Pedersen, H. K., Arumugam, M., Kristiansen, K., Voigt, A. Y., Vestergaard, H., Hercog, R., Costea, P. I., Kultima, J. R., Li, J., Jørgensen, T., Levenez, F., & 10 flereDoré, J., Nielsen, H. B., Brunak, S., Raes, J., Hansen, T., Wang, J., Ehrlich, S. D., Bork, P., Pedersen, O. & MetaHIT consortium, 3 maj 2017, I: Nature. 545, 116, 1 s., 22318.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning

21 Citationer (Scopus)

Dietary Assessment in the MetaCardis Study: Development and Relative Validity of an Online Food Frequency Questionnaire

Verger, E. O., Armstrong, P., Nielsen, T., Chakaroun, R., Aron-Wisnewsky, J., Gøbel, R. J., Schütz, T., Delaere, F., Gausseres, N., Clément, K., Holmes, B. A. & MetaCardis Consortium, jun. 2017, I: Journal of the Academy of Nutrition and Dietetics. 117, 6, s. 878-888 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

13 Citationer (Scopus)

The effect of metformin on a healthy human gut microbiota

Nielsen, T., Bryrup, T., Thomsen, C. W., Hansen, T. H., Kern, T., Allin, K. H., Jørgensen, N. R., Vestergaard, H., Hansen, T. & Pedersen, O., 2017, I: Diabetologia. 60, Suppl. 1, s. S113 1 s., 241.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning

3 Citationer (Scopus)

2016

Alterations in fecal microbiota composition by probiotic supplementation in healthy adults: a systematic review of randomized controlled trials

Kristensen, N. B., Bryrup, T., Allin, K. H., Nielsen, T., Hansen, T. H. & Pedersen, O., 10 maj 2016, I: Genome Medicine. 8, 1, 11 s., 52.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

228 Citationer (Scopus)

158 Downloads (Pure)

Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity

Pedersen, H. K., Gudmundsdottir, V., Nielsen, H. B., Hyotylainen, T., Nielsen, T., Jensen, B. A. H., Forslund, K., Hildebrand, F., Prifti, E., Falony, G., Le Chatelier, E., Levenez, F., Doré, J., Mattila, I., Plichta, D. R., Pöhö, P., Hellgren, L. I., Arumugam, M., Sunagawa, S., Vieira-Silva, S., & 14 flereJørgensen, T., Holm, J. B., Trošt, K., Kristiansen, K., Brix, S., Raes, J., Wang, J., Hansen, T., Bork, P., Brunak, S., Oresic, M., Ehrlich, S. D., Pedersen, O. B. & MetaHIT Consortium, 13 jul. 2016, I: Nature. 535, 7612, s. 376-381 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

699 Citationer (Scopus)

Roux-en-Y gastric bypass surgery of morbidly obese patients induces swift and persistent changes of the individual gut microbiota

Palleja, A., Kashani, A., Allin, K. H., Nielsen, T., Zhang, C., Li, Y., Brach, T., Liang, S., Feng, Q., Jørgensen, N. B., Bojsen-Møller, K. N., Dirksen, C., Burgdorf, K. S., Holst, J. J., Madsbad, S., Wang, J., Pedersen, O. B., Hansen, T. & Arumugam, M., 15 jun. 2016, I: Genome Medicine. 8, 13 s., 67.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

137 Citationer (Scopus)

196 Downloads (Pure)

Saffold virus infection associated with human myocarditis

Nielsen, T. S., Nielsen, A. Y., Banner, J., Hansen, J., Baandrup, U. & Nielsen, L. P., 1 jan. 2016, I: Journal of Clinical Virology. 74, s. 78-81 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › peer review

8 Citationer (Scopus)

The gut microbiota in type 2 diabetes

Nielsen, T., Allin, K. H. & Pedersen, O., 1 jan. 2016, The Genetics of Type 2 Diabetes and Related Traits: Biology, Physiology and Translation. Springer, s. 275-293 19 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

Transcriptional interactions suggest niche segregation among microorganisms in the human gut

Plichta, D. R., Juncker, A. S., Bertalan, M., Rettedal, E., Gautier, L., Varela, E., Manichanh, C., Fouqueray, C., Levenez, F., Nielsen, T., Doré, J., Machado, A. M. D., de Evgrafov, M. C. R., Hansen, T., Jørgensen, T., Bork, P., Guarner, F., Pedersen, O., Metagenomics of the Human Intestinal Tract (MetaHIT) Consortium, Sommer, M. O. A., & 4 flereEhrlich, S. D., Sicheritz-Pontén, T., Brunak, S. & Nielsen, H. B., 26 aug. 2016, I: Nature Microbiology. 1, s. 1-6 6 s., 16152.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › peer review

29 Citationer (Scopus)

2015

Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

Forslund, K., Hildebrand, F., Nielsen, T., Falony, G., Le Chatelier, E., Sunagawa, S., Prifti, E., Vieira-Silva, S., Gudmundsdottir, V., Pedersen, H. K., Arumugam, M., Kristiansen, K., Yvonne Voigt, A., Vestergaard, H., Hercog, R., Igor Costea, P., Roat Kultima, J., Li, J., Jørgensen, T., Levenez, F., & 9 flereDore, J., Nielsen, H. B., Brunak, S., Raes, J., Hansen, T., Wang, J., Dusko Ehrlich, S., Bork, P. & Pedersen, O. B., 10 dec. 2015, I: Nature. 528, 7581, s. 262-266 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

856 Citationer (Scopus)

MECHANISMS IN ENDOCRINOLOGY: Gut microbiota in patients with type 2 diabetes mellitus

Allin, K. H., Nielsen, T. & Pedersen, O., 2015, I: European Journal of Endocrinology. 172, 4, s. R167-R177 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review

89 Citationer (Scopus)

2014

An integrated catalog of reference genes in the human gut microbiome

Li, J., Jia, H., Cai, X., Zhong, H., Feng, Q., Sunagawa, S., Arumugam, M., Kultima, J. R., Prifti, E., Nielsen, T., Juncker, A., Manichanh, C., Chen, B., Zhang, W., Levenez, F., Wang, J., Xu, X., Xiao, L., Liang, S., Zhang, D., & 17 flereZhang, Z., Chen, W., Zhao, H., Al-Aama, J. Y., Edris, S., Yang, H., Wang, J., Hansen, T., Nielsen, H. B., Brunak, S., Kristiansen, K., Guarner, F., Pedersen, O., Doré, J., Ehrlich, S. D., Bork, P. & Wang, J., 1 aug. 2014, I: Nature Biotechnology. 32, 8, s. 834-845 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

823 Citationer (Scopus)

Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes

Nielsen, H. B., Almeida, M., Juncker, A., Rasmussen, S., Li, J., Sunagawa, S., Plichta, D. R., Gautier, L., Pedersen, A. G., Le Chatelier, E., Pelletier, E., Bonde, I., Nielsen, T., Manichanh, C., Arumugam, M., Batto, J-M., dos Santos, M. B. Q., Blom, N., Borruel, N., Burgdorf, K. S., & 31 flereBoumezbeur, F., Casellas, F., Doré, J., Dworzynski, P., Guarner, F., Hansen, T., Hildebrand, F., Kaas, R. S., Kennedy, S., Kristiansen, K., Kultima, J. R., Léonard, P., Levenez, F., Lund, O., Moumen, B., Le Paslier, D., Pons, N., Pedersen, O. B., Prifti, E., Qin, J., Raes, J., Sørensen, S. J., Tap, J., Tims, S., Ussery, D., Yamada, T., Renault, P., Sicheritz-Pontén, T., Bork, P., Wang, J. & MetaHIT Consortium, 1 aug. 2014, I: Nature Biotechnology. 32, 8, s. 822–828 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

454 Citationer (Scopus)

2013

Mutations in HNF1A result in marked alterations of plasma glycan profile

Thanabalasingham, G., Huffman, J. E., Kattla, J. J., Novokmet, M., Rudan, I., Gloyn, A. L., Hayward, C., Adamczyk, B., Reynolds, R. M., Muzinic, A., Hassanali, N., Pucic, M., Bennett, A. J., Essafi, A., Polasek, O., Mughal, S. A., Redzic, I., Primorac, D., Zgaga, L., Kolcic, I., & 20 flereHansen, T., Gasperikova, D., Tjora, E., Strachan, M. W. J., Nielsen, T., Stanik, J., Klimes, I., Pedersen, O. B., Njølstad, P. R., Wild, S. H., Gyllensten, U., Gornik, O., Wilson, J. F., Hastie, N. D., Campbell, H., McCarthy, M. I., Rudd, P. M., Owen, K. R., Lauc, G. & Wright, A. F., apr. 2013, I: Diabetes. 62, 4, s. 1329-37 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

55 Citationer (Scopus)

Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers

Le Chatelier, E., Nielsen, T., Qin, J., Prifti, E., Hildebrand, F., Falony, G., Almeida, M., Arumugam, M., Batto, J-M., Kennedy, S., Leonard, P., Li, J., Burgdorf, K. S., Grarup, N., Jørgensen, T., Brandslund, I., Nielsen, H. B., Juncker, A., dos Santos, M. B. Q., Levenez, F., & 62 flerePons, N., Rasmussen, S., Sunagawa, S., Tap, J., Tims, S., Zoetendal, E. G., Brunak, S., Clément, K., Doré, J., Kleerebezem, M., Kristiansen, K., Renault, P., Sicheritz-Ponten, T., de Vos, W. M., Zucker, J-D., Raes, J., Hansen, T., Bork, P., Wang, J., Ehrlich, S. D., Pedersen, O. B., Guedon, E., Delorme, C., Layec, S., Khaci, G., van de Guchte, M., Vandemeulebrouck, G., Jamet, A., Dervyn, R., Sanchez, N., Maguin, E., Haimet, F., Winogradski, Y., Cultrone, A., Leclerc, M., Juste, C., Blottière, H., Pelletier, E., LePaslier, D., Artiguenave, F., Bruls, T., Weissenbach, J., Turner, K., Parkhill, J., Antolin, M., Manichanh, C., Casellas, F., Boruel, N., Varela, E., Torrejon, A., Guarner, F., Denariaz, G., Derrien, M., van Hylckama Vlieg, J. E. T., Veiga, P., Oozeer, R., Knol, J., Rescigno, M., Brechot, C., Mérieux, A., M'Rini, C. & Yamada, T., 2013, I: Nature. 500, 7464, s. 541-546 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

2055 Citationer (Scopus)

The frequent UCP2 -866G>A polymorphism protects against insulin resistance and is associated with obesity: a study of obesity and related metabolic traits among 17¿636 Danes

Andersen, G., Dalgaard, L. T., Justesen, J. M., Anthonsen, S., Nielsen, T., Thørner, L. W., Witte, D., Jørgensen, T., Clausen, J. O., Lauritzen, T., Holmkvist, J., Hansen, T. & Pedersen, O., feb. 2013, I: International Journal of Obesity.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

30 Citationer (Scopus)

2011

Enterotypes of the human gut microbiome: [Plus]Corrigendum [Plus]Addendum

Arumugam, M., Raes, J., Pelletier, E., Le Paslier, D., Yamada, T., Mende, D. R., Fernandes, G. R., Tap, J., Bruls, T., Batto, J-M., dos Santos, M. B. Q., Borruel, N., Casellas, F., Fernandez, L., Gautier, L., Hansen, T., Hattori, M., Hayashi, T., Kleerebezem, M., Kurokawa, K., & 31 flereLeclerc, M., Levenez, F., Manichanh, C., Nielsen, H. B., Nielsen, T., Pons, N., Poulain, J., Qin, J., Sicheritz-Ponten, T., Tims, S., Torrents, D., Ugarte, E., Zoetendal, E. G., Wang, J., Guarner, F., Pedersen, O., de Vos, W. M., Brunak, S., Doré, J., Antolín, M., Artiguenave, F., Blottiere, H. M., Almeida, M., Brechot, C., Cara, C., Chervaux, C., Cultrone, A., Delorme, C., Denariaz, G., Kristiansen, K. & MetaHIT Consortium, 2011, I: Nature. 473, 7346, s. 174-180 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

3580 Citationer (Scopus)

Type 2 diabetes risk allele near CENTD2 is associated with decreased glucose-stimulated insulin release

Nielsen, T., Sparsø, T., Grarup, N., Jørgensen, T., Pisinger, C. H., Witte, D. R., Hansen, T., Pedersen, O. & Diabetes Genetics Replication and Meta-analysis (DIAGRAM) Consortium, 1 maj 2011, I: Diabetologica. 54, 5, s. 1052-6 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

28 Citationer (Scopus)

2010

A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing

MetaHIT Consortium, 2010, I: Nature. 464, 7285, s. 59-65 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5947 Citationer (Scopus)

775 Downloads (Pure)

2009

A variant in the G6PC2/ABCB11 locus is associated with increased fasting plasma glucose, increased basal hepatic glucose production and increased insulin release after oral and intravenous glucose loads

Rose, C. S., Grarup, N., Krarup, N. T., Poulsen, P., Wegner, L., Nielsen, T., Banasik, K., Faerch, K., Andersen, G., Albrechtsen, A., Borch-Johnsen, K., Clausen, J. O., Jørgensen, T., Vaag, A., Pedersen, O. & Hansen, T., 2009, I: Diabetologia. 52, 10, s. 2122-2129 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

22 Citationer (Scopus)

2008

The KCNMB1 Glu65Lys polymorphism associates with reduced systolic and diastolic blood pressure in the Inter99 study of 5729 Danes.

Nielsen, T., Burgdorf, K. S., Grarup, N., Borch-Johnsen, K., Hansen, T., Jørgensen, T., Pedersen, O. & Andersen, G., 2008, I: Journal of Hypertension. 26, 11, s. 2142-6 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

25 Citationer (Scopus)

Trine Nielsen

Publikation

Søgeresultater