Jeppe Vinther

2019

Detection of internal N7-methylguanosine (m⁷G) RNA modifications by mutational profiling sequencing

Enroth, C., Poulsen, L. D., Iversen, S., Kirpekar, F., Albrechtsen, A. & Vinther, J., 18 nov. 2019, I: Nucleic Acids Research. 47, 20, 13 s., e126.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

4 Downloads (Pure)

Excess primer degradation by Exo I improves the preparation of 3' cDNA ligation-based sequencing libraries

Enroth, C. H., Fehler, A. O., Poulsen, L. D. & Vinther, J., 2019, I: BioTechniques. 67, 3, s. 110-116

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

12 Downloads (Pure)

2018

RNA-Seq for Bacterial Gene Expression

Poulsen, L. D. & Vinther, J., 2018, I: Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry. 73, 1, s. 1-12 e55.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

2017

RNase H sequence preferences influence antisense oligonucleotide efficiency

Kiełpiński, Ł. J., Hagedorn, P. H., Lindow, M. & Vinther, J., 15 dec. 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 22, s. 12932-12944 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

20 Citationer (Scopus)

44 Downloads (Pure)

2016

Effect of chronic uremia on the transcriptional profile of the calcified aorta analyzed by RNA sequencing

Rukov, J. L., Gravesen, E., Mace, M. L., Hofman-Bang, J., Vinther, J., Andersen, C. B., Lewin, E. & Ølgaard, K., 15 mar. 2016, I: American Journal of Physiology: Renal Physiology. 310, 6, s. F477-F491 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

27 Citationer (Scopus)

2015

Dissecting the target specificity of RNase H recruiting oligonucleotides using massively parallel reporter analysis of short RNA motifs

Rukov, J. L., Hagedorn, P. H., Høy, I. B., Feng, Y., Lindow, M. & Vinther, J., 30 sep. 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 17, s. 8476-8487 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

72 Downloads (Pure)

Reproducible analysis of sequencing-based RNA structure probing data with user-friendly tools

Kielpinski, L. J., Sidiropoulos, N. & Vinther, J., 2015, Structures of large RNA molecules and their complexes. Woodson, S. A. & Allain, F. H. T. (red.). Elsevier, s. 153-180 28 s. (Methods in Enzymology, Bind 558).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

SHAPE selection (SHAPES) enrich for RNA structure signal in SHAPE sequencing-based probing data

Poulsen, L. D., Kielpinski, L. J., Salama, S. R., Krogh, A. & Vinther, J., 1 maj 2015, I: R N A. 21, 5, s. 1042-1052 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

24 Citationer (Scopus)

134 Downloads (Pure)

2014

Massive parallel-sequencing-based hydroxyl radical probing of RNA accessibility

Kielpinski, L. J. & Vinther, J., apr. 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, 8, 12 s., e70.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

31 Citationer (Scopus)

980 Downloads (Pure)

Pharmaco-miR: linking microRNAs and drug effects

Rukov, J. L., Wilentzik, R., Jaffe, I., Vinther, J. & Shomron, N., jul. 2014, I: Briefings in Bioinformatics. 15, 4, s. 648-659 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

85 Citationer (Scopus)

45 Downloads (Pure)

2013

Body fluid identification of blood, saliva and semen using second generation sequencing of micro-RNA

Petersen, C. H., Hjort, B. B., Tvedebrink, T., Kielpinski, L. J., Vinther, J. & Morling, N., 2013, I: Forensic Science International: Genetics Supplement Series. 4, 1, s. e204-5 2 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

3 Citationer (Scopus)

3308 Downloads (Pure)

Detection of reverse transcriptase termination sites using cDNA ligation and massive parallel sequencing

Kielpinski, L. J., Boyd, M., Sandelin, A. & Vinther, J., 2013, I: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1038, s. 213-31 19 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

11 Citationer (Scopus)

2012

MicroRNAs and Their Antagonists as Novel Therapeutics

Vinther, J., Rukov, J. & Shomron, N., 1 jan. 2012, From Nucleic Acids Sequences to Molecular Medicine. Erdmann, V. A. & Barciszewski, J. (red.). Springer Publishing Company, s. 503-523 21 s. (RNA Technologies).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

3 Citationer (Scopus)

2011

Pharmacogenomics genes show varying perceptibility to microRNA regulation

Rukov, J. L., Vinther, J. & Shomron, N., maj 2011, I: Pharmacogenetics and Genomics. 21, 5, s. 251-62 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

22 Citationer (Scopus)

2010

The early noncoding region of human papillomavirus type 16 is regulated by cytoplasmic polyadenylation factors

Glahder, J.-A. H., Kristiansen, K., Durand, M., Vinther, J. & Norrild, B., maj 2010, I: Virus Research. 149, 2, s. 217-223 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

4 Citationer (Scopus)

2009

Quantitative regulation of alternative splicing in evolution and development

Irimia, M., Rukov, J. L., Roy, S. W., Vinther, J. & Garcia-Fernandez, J., 2009, I: BioEssays. 31, 1, s. 40-50 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

32 Citationer (Scopus)

2008

Conserved CPEs in the p53 3' untranslated region influence mRNA stability and protein synthesis

Rosenstierne, M. W., Vinther, J., Mittler, G., Larsen, L., Mann, M. & Norrild, B., 2008, I: Anticancer Research. 28, 5A, s. 2553-9 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

12 Citationer (Scopus)

Identification of let-7-regulated oncofetal genes.

Boyerinas, B., Park, S.-M., Shomron, N., Hedegaard, M. M., Vinther, J., Andersen, J. S., Feig, C., Xu, J., Burge, C. B. & Peter, M. E., 2008, I: Cancer Research. 68, 8, s. 2587-91 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

172 Citationer (Scopus)

Mutation of miRNA target sequences during human evolution.

Gardner, P. P. & Vinther, J., 2008, I: Trends in Genetics. 24, 6, s. 262-5 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

21 Citationer (Scopus)

Origin of introns by 'intronization' of exonic sequences.

Irimia, M., Rukov, J. L., Penny, D., Vinther, J., Garcia-Fernandez, J. & Roy, S. W., 2008, I: Trends in Genetics.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

59 Citationer (Scopus)

2007

High qualitative and quantitative conservation of alternative splicing in Caenorhabditis elegans and Caenorhabditis briggsae.

Rukov, J. L., Irimia, M., Mørk, S., Lund, V. K., Vinther, J. & Arctander, P., 2007, I: Molecular Biology and Evolution. 24, 4, s. 909-17 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

26 Citationer (Scopus)

High qualitative and quantitative conservation of alternative splicing in Caenorhabditis elegans and Caenorhabditis briggsae.

Rukov, J. L., Irimia, M., Mørk, S., Lund, V. K., Vinther, J. & Arctander, P., 1 feb. 2007, I: Molecular Biology and Evolution. 24, 4, s. 909–917 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Use of tiling array data and RNA secondary structure predictions to identify noncoding RNA genes.

Weile, C., Gardner, P. P., Hedegaard, M. M. & Vinther, J., 2007, I: BMC Genomics. 8, s. 244

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

10 Citationer (Scopus)

Widespread evolutionary conservation of alternatively spliced exons in caenorhabditis.

Irimia, M., Rukov, J. L., Penny, D., Garcia-Fernandez, J., Vinther, J. & Roy, S. W., 2007, I: Molecular Biology and Evolution. 25, 2, s. 375-82 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

38 Citationer (Scopus)

2006

Identification of miRNA targets with stable isotope labeling by amino acids in cell culture.

Vinther, J., Hedegaard, M. M., Gardner, P. P., Andersen, J. S. & Arctander, P., 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 16, s. e107

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

102 Citationer (Scopus)

2005

The 3' region of human papillomavirus type 16 early mRNAs decrease expression

Vinther, J., Rosenstierne, M. W., Kristiansen, K. & Norrild, B., 2005, I: BMC Infectious Diseases. 5, s. 83

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

10 Citationer (Scopus)

The 3' region of human papillomavirus type 16 early nRNAs decrease expression

Vinther, J., Rosenstierne, M., Kristiansen, K. & Norrild, B., 2005, I: BMC Infect. Dis.. 5, s. 83

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

2003

A promoter within the E6 ORF of human papillomavirus type 16 contributes to the expression of the E7 oncoprotein from a monocistronic mRNA

Glahder, J.-A. H., Hansen, C. N., Vinther, J., Madsen, B. S. & Norrild, B., 2003, I: Journal of General Virology. 84, Pt 12, s. 3429-41 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

21 Citationer (Scopus)

A putative promotor within the E6 ORF of human papillomavirus type 16 controls the expression of the E7 oncoprotein from a monocistronic mRNA

Glahder, J., Hansen, C. N., Vinther, J., Madsen, B. S. & Norrild, B., 2003, I: Journal of General Virology. 84, s. 3429-3441

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Clearance of cervical human papillomavirus infections

Vinther, J. & Norrild, B., 2003, I: International Journal of Cancer. 104, s. 255-256

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

6 Citationer (Scopus)

Identification and characterisation of a cluster of transcription start sites in the E6 ORF of the Human Papillomavirus type 16

Rosenstierne, M., Vinther, J., Hansen, C., Fenger-Grøn, M. & Norrild, B., 2003, I: J.Gen.Virol.. 84, s. 2909-2920

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Identification and characterization of a cluster of transcription start sites located in the E6 ORF of human papillomavirus type 16

Rosenstierne, M. W., Vinther, J., Hansen, C. N., Prydsoe, M. & Norrild, B., 2003, I: Journal of General Virology. 84, Pt 11, s. 2909-20 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

11 Citationer (Scopus)

Jeppe Vinther

Publikation

Søgeresultater