Witold Piotr Kot

2019

A Novel and Direct Metamobilome Approach improves the Detection of Larger-sized Circular Elements across Kingdoms

Alanin, K. S., Joergensen, T. S., Browne, P. D., Petersen, B., Riber, L., Kot, W. P. & Hansen, L. H., 2019, (Afsendt) I: bioRxiv. 761098.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

1 Downloads (Pure)

A novel six-phage cocktail reduces Pectobacterium atrosepticum soft rot infection in potato tubers under simulated storage conditions

Carstens, A. B., Djurhuus, A. M., Kot, W. & Hansen, L. H., 16 maj 2019, I: FEMS Microbiology Letters. 366, 9, s. 1-8 fnz101.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › peer review

11 Citationer (Scopus)

Development of the equine gut microbiota

Lindenberg, F., Krych, L., Kot, W., Fielden, J., Frøkiær, H., van Galen, G., Nielsen, D. S. & Hansen, A. K., 1 dec. 2019, I: Scientific Reports. 9, 1, 9 s., 14427.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

29 Downloads (Pure)

Expanding the Diversity of Myoviridae Phages Infecting Lactobacillus plantarum-A Novel Lineage of Lactobacillus Phages Comprising Five New Members

Kyrkou, I., Byth Carstens, A., Ellegaard-Jensen, L., Kot, W., Zervas, A., Djurhuus, A. M., Neve, H., Hansen, M. & Hestbjerg Hansen, L., 4 jul. 2019, I: Viruses. 11, 7

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

Expression of immune regulatory genes correlate with the abundance of specific Clostridiales and Verrucomicrobia species in the equine ileum and cecum

Lindenberg, F., Krych, L., Fielden, J., Kot, W., Frøkiær, H., van Galen, G., Nielsen, D. S. & Hansen, A. K., 2019, I: Scientific Reports. 9, 1, 10 s., 12674.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

15 Citationer (Scopus)

18 Downloads (Pure)

Genomic and Ecogenomic Characterization of Proteus mirabilis Bacteriophages

Alves, D. R., Nzakizwanayo, J., Dedi, C., Olympiou, C., Hanin, A., Kot, W., Hansen, L., Lametsch, R., Gahan, C. G. M., Schellenberger, P., Ogilvie, L. A. & Jones, B. V., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, s. 1-14 1783.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

4 Citationer (Scopus)

15 Downloads (Pure)

Gut and immune effects of bioactive milk factors in preterm pigs exposed to prenatal inflammation

Ren, S., Hui, Y., Goericke-Pesch, S., Pankratova, S., Kot, W., Pan, X., Thymann, T., Sangild, P. T. & Nguyen, D. N., jul. 2019, I: American Journal of Physiology: Gastrointestinal and Liver Physiology. 317, 1, s. G67-G77

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

10 Citationer (Scopus)

Mouse vendor influence on the bacterial and viral gut composition exceeds the effect of diet

Rasmussen, T. S., de Vries, L., Kot, W., Hansen, L. H., Castro-Mejía, J. L., Vogensen, F. K., Hansen, A. K. & Nielsen, D. S., 2019, I: Viruses. 11, 5, 15 s., 435.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

21 Citationer (Scopus)

21 Downloads (Pure)

Short communication: Gut microbial colonization of the mouse colon using faecal transfer was equally effective when comparing rectal inoculation and oral inoculation based on 16S rRNA sequencing

Lützhøft, D. O., Sánchez-Alcoholado, L., Tougaard, P., Junker Mentzel, C. M., Kot, W., Nielsen, D. S. & Hansen, A. K., 2019, I: Research in Veterinary Science. 126, s. 227-232 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

2018

Investigation of the bacteriophage community in induced lysates of undefined mesophilic mixed-strain DL-cultures using classical and metagenomic approaches

Muhammed, M. K., Olsen, M. L., Kot, W. P., Neve, H., Castro Mejia, J. L., Janzen, T., Hansen, L. H., Nielsen, D. S., Sørensen, S. J., Heller, K. J. & Vogensen, F. K., 2 maj 2018, I: International Journal of Food Microbiology. 272, s. 61-72 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

2017

Metagenomic analysis of dairy bacteriophages: extraction method and pilot study on whey samples derived from using undefined and defined mesophilic starter cultures

Muhammed, M. K., Kot, W. P., Neve, H., Mahony, J., Castro Mejia, J. L., Krych, L., Hansen, L. H., Nielsen, D. S., Sørensen, S. J., Heller, K. J., van Sinderen, D. & Vogensen, F. K., 2017, I: Applied and Environmental Microbiology. 83, 19, 15 s., e00888-17.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

9 Citationer (Scopus)

2016

Type 3 fimbriae encoded on plasmids are expressed from a unique promoter without affecting host motility, facilitating an exceptional phenotype that enhances conjugal plasmid transfer

Madsen, J. S., Riber, L., Kot, W. P., Basfeld, A., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., sep. 2016, I: P L o S One. 11, 9, 19 s., e0162390.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

10 Citationer (Scopus)

94 Downloads (Pure)

2015

Draft genome sequence of MCPA-degrading Sphingomonas sp. strain ERG5, isolated from a groundwater aquifer in Denmark

Nielsen, T. K., Kot, W. P., Sørensen, S. R. & Hansen, L. H., 2015, I: Genome Announcements. 3, 1, 2 s., e01529-14.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

2 Citationer (Scopus)

57 Downloads (Pure)

Optimizing protocols for extraction of bacteriophages prior to metagenomic analyses of phage communities in the human gut

Castro Mejia, J. L., Muhammed, M. K., Kot, W. P., Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, L. H., Vogensen, F. K. & Nielsen, D. S., 17 nov. 2015, I: Microbiome. 3, 14 s., 64.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

62 Citationer (Scopus)

466 Downloads (Pure)

2014

Bacteriophages of Leuconostoc, Oenococcus, and Weissella

Kot, W., Neve, H., Heller, K. J. & Vogensen, F. K., 2014, I: Frontiers in Microbiology. 5, s. 1-9 9 s., 186.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

35 Citationer (Scopus)

1323 Downloads (Pure)

Combined use of Bacteriophage K and a novel Bacteriophage to reduce Staphylococcus aureus biofilm formation

Alves, D. R., Gaudion, A., Bean, J. E., Esteban, P. P., Arnot, T. C., Harper, D. R., Kot, W. P., Hansen, L. H., Enright, M. C. & Jenkins, A. T. A., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 21, s. 6694-6703 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

80 Citationer (Scopus)

Complete genome sequences of four novel Lactococcus lactis phages distantly related to the Rare 1706 Phage Species

Kot, W. P., Neve, H., Vogensen, F. K., Heller, K. J., Sørensen, S. J. & Hansen, L. H., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00265-14.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

4 Citationer (Scopus)

1024 Downloads (Pure)

DPS - a rapid method for genome sequencing of DNA-containing bacteriophages directly from a single plaque

Kot, W. P., Vogensen, F. K., Sørensen, S. J. & Hansen, L. H., feb. 2014, I: Journal of Virological Methods. 196, s. 152-156 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

25 Citationer (Scopus)

Genome sequence of Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris strain T26, isolated from mesophilic undefined cheese starter

Pedersen, T. B., Kot, W. P., Hansen, L. H., Sørensen, S. J., Broadbent, J. R., Vogensen, F. K. & Ardö, Y. M., 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

1166 Downloads (Pure)

Genome sequences of two Leuconostoc pseudomesenteroides strains isolated from Danish dairy starter cultures

Pedersen, T. B., Kot, W. P., Hansen, L. H., Sørensen, S. J., Broadbent, J. R., Vogensen, F. K. & Ardö, Y. M., 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, s. 2 e00484-14.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

874 Downloads (Pure)

Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

Kot, W. P., Hansen, L. H., Neve, H., Hammer, K., Jacobsen, S., Pedersen, P. D., Sørensen, S. J., Heller, K. J. & Vogensen, F. K., 17 apr. 2014, I: International Journal of Food Microbiology. 176, s. 29-37 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

14 Citationer (Scopus)

2013

Classification of lytic bacteriophages attacking dairy Leuconostoc starter strains

Ali, Y., Kot, W. P., Atamer, Z., Hinrichs, J., Vogensen, F. K., Heller, K. J. & Neve, H., jun. 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 12, s. 3628-3636 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

24 Citationer (Scopus)

Identification of the receptor-binding protein in lytic Leuconostoc pseudomesenteroides bacteriophages

Kot, W. P., Hammer, K., Neve, H. & Vogensen, F. K., maj 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 10, s. 3311-3314 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

15 Citationer (Scopus)

Investigation of the relationship between lactococcal host cell wall polysaccharide genotype and 936 phage receptor binding protein phylogeny

Mahony, J., Kot, W. P., Murphy, J., Ainsworth, S., Neve, H., Hansen, L. H., Heller, K. J., Sørensen, S. J., Hammer, K., Cambillau, C., Vogensen, F. K. & Sinderen, D. V., jul. 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 14, s. 4385-4392 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

69 Citationer (Scopus)

2012

Phage-host interaction in Lactococcus and Leuconostoc

Kot, W. P., 2012, Department of Food Science, University of Copenhagen. 187 s.

Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling

2011

Sequence and comparative analysis of Lactococcus lactis c2 dairy bacteriphages with different thermal inactivation

Vogensen, F. K., Nielsen, C. L. M., Bashir, A., Kot, W. P., Hansen, L. H., Neve, H., Heller, K. J., Sørensen, S. J. & Knøchel, S., aug. 2011.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

595 Downloads (Pure)

Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

Kot, W. P., Hansen, L. H., Neve, H., Hammer, K., Pedersen, P. D., Sørensen, S. J., Heller, K. J. & Vogensen, F. K., maj 2011. 1 s.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

2573 Downloads (Pure)

Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

Kot, W. P., Hansen, L. H., Neve, H., Hammer, K., Sørensen, S. J., Heller, K. J. & Vogensen, F. K., 2011. 1 s.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

570 Downloads (Pure)

2010

Influence Of Flow-Rate, Surface Soiling And Pre-Exposure To Sub-Lethal Stress On Initial Attachment Of Listeria monocytogenes On Solid Surfaces Under Liquid Flow

Szlavik, J., Soares Paiva, D., Kot, W. P. & Nielsen, D. S., aug. 2010, 22nd International ICFMH Symposium Food Micro 2010. Copenhagen, 1 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning

123 Downloads (Pure)

Witold Piotr Kot

Publikation

Søgeresultater