Microbiology

2012

Ecology and photobiology of chlorophyll d-containing cyanobacteria

Kühl, M., Behrendt, L., Trampe, E. C. L., Sørensen, S. J., Chen, M., Qvortrup, K. & Larkum, AWD., 2012.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

Ecology and photobiology of chlorophyll d-containing cyanobacteria

Kühl, M., Behrendt, L., Trampe, E. C. L., Sørensen, S. J., Chen, M., Qvortrup, K. & Larkum, A. W. D., 2012.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

Enzymatic oxalic acid regulation correlated with wood degradation in four brown-rot fungi

Hastrup, A. C. S., Green, F., Lebow, P. K. & Jensen, B., nov. 2012, I: International Biodeterioration and Biodegradation. 75, s. 109-114 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

21 Citationer (Scopus)

Extreme emission of N₂O from tropical wetland soil (Pantanal, South America)

Møller, L. L. H., Nielsen, L. P., Revsbech, N. P., Priemé, A., Elberling, B., Enrich-Prast, A. & Kühl, M., 2012, I: Frontiers in Microbiology. 3, 13 s., 433.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

26 Citationer (Scopus)

150 Downloads (Pure)

Extreme emission of n₂o from tropical wetland soil (pantanal, South America)

Møller, L. L. H., Nielsen, L. P., Revsbech, N. P., Priemé, A., Elberling, B., Enrich-Prast, A. & Kühl, M., 2012, I: Frontiers in Microbiology. 3, s. 1-13 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

26 Citationer (Scopus)

2651 Downloads (Pure)

Fitness cost: a bacteriological explanation for the demise of the first international methicillin-resistant Staphylococcus aureus epidemic

Nielsen, K. L., Pedersen, T. M., Udekwu, K. I., Petersen, A., Skov, R. L., Hansen, L. H., Hughes, D. & Frimodt-Moller, N., jun. 2012, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 67, 6, s. 1325-1332 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

32 Citationer (Scopus)

Gut microbiota composition is correlated to grid floor induced stress and behavior in the BALB/c mouse

Bendtsen, K. M. B., Krych, L., Sørensen, D. B., Pang, W., Nielsen, D. S., Josefsen, K., Hansen, L. H., Sørensen, S. J. & Hansen, A. J. K., 2 okt. 2012, I: P L o S One. 7, 10, 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

163 Citationer (Scopus)

Heterogeneity in recombinant protein production

Schalén, M., Johanson, T., Neves Lundin, A. L., Sørensen, S. J. & Lantz, A. E., 2012, I: New Biotechnology. 29, Supplement, 0, s. S78 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › peer review

High robustness of soil bacteria and funghi to multifactorial climate change manipulations

Bergmark, L., Haugwitz-Hardenberg-Reventlow, M. S., Sørensen, S. J. & Priemé, A., 2012.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

Insight from the draft genome of Dietzia cinnamea P4 reveals mechanisms of survival in complex tropical soil habitats and biotechnology potential

Procópio, L., Alvarez, V. M., Jurelevicius, D. A., Hansen, L. H., Sørensen, S. J., Cardoso, J. S., Pádula, M., Leitao, Á. C., Seldin, L. & van Elsas, J. D., feb. 2012, I: Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology. 101, 2, s. 289-302 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

24 Citationer (Scopus)

305 Downloads (Pure)

Kin selection, quorum sensing and virulence in pathogenic bacteria

Rumbaugh, K. P., Trivedi, U., Watters, C., Burton-Chellew, M. N., Diggle, S. P. & West, S. A., 7 sep. 2012, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 279, 1742, s. 3584-8 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

52 Citationer (Scopus)

Limiting the occurrence of antimicrobial resistance through targeted interventions directed at plasmid stability

Riber, L., Burmølle, M., Milani, S. M., Alm, M., Thomsen, P., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2012.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

Metamobilomics — expanding our knowledge on the pool of plasmid encoded traits in natural environments using high-throughput sequencing

Li, L., Norman, A., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., jul. 2012, I: Clinical Microbiology and Infection. 18, Suppl. 4, s. 8-11 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

26 Citationer (Scopus)

Metamorphosis in balanomorphan, pedunculated, and parasitic barnacles: a video-based analysis

Høeg, J. T., Maruzzo, D., Okano, K., Glenner, H. & Chan, B. K. K., sep. 2012, I: Integrative and Comparative Biology. 52, 3, s. 337-347 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

27 Citationer (Scopus)

568 Downloads (Pure)

Microbial diversity of biofilm communities in microniches associated with the didemnid ascidian Lissoclinum patella

Behrendt, L., Larkum, A. W. D., Trampe, E. C. L., Norman, A., Sørensen, S. J. & Kühl, M., jun. 2012, I: I S M E Journal. 6, s. 1222-1237 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

54 Citationer (Scopus)

Mining of unexplored habitats for novel chitinases - chiA as a helper gene proxy in metagenomics

Cretoiu, M. S., Kielak, A. M., Abu Al-Soud, W., Sørensen, S. J. & van Elsas, J. D., jun. 2012, I: Applied Microbiology and Biotechnology. 94, 5, s. 1347-1358 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

31 Citationer (Scopus)

Novel and conserved bacterial mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine

Kroer, N., Møller, A., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2012.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

Permissiveness of soil microbial communities toward receipt of mobile genetic elements

Musovic, S., Klümper, U., Neves Lundin, A. L., Sørensen, S. J. & Smets, B. F., 2012.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

Phage-host interaction in Lactococcus and Leuconostoc

Kot, W. P., 2012, Department of Food Science, University of Copenhagen. 187 s.

Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling

Physiological heterogeneities in microbial populations and implications for physical stress tolerance

Carlqvist, M., Lencastre Fernandes, R., Helmark, S., Heins, A-L., Neves Lundin, A. L., Sørensen, S. J., Gernaey, K. & Eliasson Lantz, A., 2012, I: Microbial Cell Factories. 11, 94, 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

44 Citationer (Scopus)

524 Downloads (Pure)

Primary cilia and aberrant cell signaling in epithelial ovarian cancer

Egeberg, D. L., Lethan, M., Manguso, R., Schneider, L., Awan, A., Jørgensen, T. S., Byskov, A. G., Pedersen, L. B. & Christensen, S. T., 10 aug. 2012, I: Cilia. 1, 15, 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

48 Citationer (Scopus)

1152 Downloads (Pure)

Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing

Zakrzewski, M., Goesmann, A., Jaenicke, S., Jünemann, S., Eikmeyer, F., Szczepanowski, R., Abu Al-Soud, W., Sørensen, S. J., Pühler, A. & Schlüter, A., 30 apr. 2012, I: Journal of Biotechnology. 158, 4, s. 248-258 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

155 Citationer (Scopus)

Selection for Cu-tolerant bacterial communities with altered composition, but unaltered richness, via long-term Cu exposure

Berg, J., Brandt, K. K., Abu Al-Soud, W., Holm, P. E., Hansen, L. H., Sørensen, S. J. & Nybroe, O., okt. 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 20, s. 7438-7446 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

120 Citationer (Scopus)

Sequencing of IncX-plasmids suggests ubiquity of mobile forms of a biofilm-promoting gene cassette recruited from Klebsiella pneumoniae

Burmølle, M., Norman, A., Sørensen, S. J. & Hansen, L. H., 23 jul. 2012, I: PLOS ONE. 7, 7, 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

29 Citationer (Scopus)

980 Downloads (Pure)

Temporal trends in N₂O flux dynamics in a Danish wetland – effects of plant-mediated gas transport of N₂O and O₂following changes in water level and soil mineral-N availability

Jørgensen, C. J., Struwe, S. & Elberling, B., jan. 2012, I: Global Change Biology. 18, 1, s. 210-222 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

83 Citationer (Scopus)

The fate of indigenous microbiota, starter cultures, Escherichia coli, Listeria innocua and Staphylococcus aureus in Danish raw milk and cheeses determined by pyrosequencing and quantitative real time (qRT)-PCR

Masoud, W. M. H., Vogensen, F. K., Lillevang, S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, S. J. & Jakobsen, M., 1 feb. 2012, I: International Journal of Food Microbiology. 153, 1-2, s. 192-202 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

92 Citationer (Scopus)

The fate of mercury in Arctic terrestrial and aquatic ecosystems, a review

Douglas, T. A., Loseto, L. L., Macdonald, R. W., Outridge, P., Dommergue, A., Poulain, A., Amyot, M., Barkay, T., Berg, T., Chételat, J., Constant, P., Evans, M., Ferrari, C., Gantner, N., Johnson, M. S., Kirk, J., Kroer, N., Larose, C., Lean, D., Nielsen, T. G., & 7 flerePoissant, L., Rognerud, S., Skov, H., Sørensen, S. J., Wang, F., Wilson, S. & Zdanowicz, C. M., 2012, I: Environmental Chemistry (Online). 9, 4, s. 321-355 35 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review

79 Citationer (Scopus)

The genome sequence of the lactic acid bacterium, Carnobacterium maltaromaticum ATCC 35586 encodes potential virulence factors

Leisner, J., Hansen, M. A., Larsen, M. H., Hansen, L., Ingmer, H. & Sørensen, S. J., 16 jan. 2012, I: International Journal of Food Microbiology. 152, 3, s. 107-115 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

29 Citationer (Scopus)

The interconnection between biofilm formation and horizontal gene transfer

Madsen, J. S., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., jul. 2012, I: F E M S Immunology and Medical Microbiology. 65, 2, s. 183-195 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review

265 Citationer (Scopus)

Up-scaling of water use efficiency from leaf to canopy as based on leaf gas exchange relationships and the modeled in-canopy light distribution

Linderson, M-L., Mikkelsen, T. N., Ibrom, A., Lindroth, A., Ro-Poulsen, H. & Pilegaard, K., 15 jan. 2012, I: Agricultural and Forest Meteorology. 152, s. 201-211 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

26 Citationer (Scopus)

When it makes sense to socialize whilst being on the move: A small EAL-domain containing protein, encoded on natural biofilm-promoting plasmids, triggers motility

Madsen, J. S., Riber, L., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2012.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

2011

An Unexpected Location of the Arginine Catabolic Mobile Element (ACME) in a USA300-Related MRSA Strain

Damkjær Bartels, M., Hansen, L. H., Boye, K., Sørensen, S. J. & Westh, H. T., 2011, I: P L o S One. 6, 1, s. e16193 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

35 Citationer (Scopus)

1017 Downloads (Pure)

Applicability of GFP microbial whole cell biosensors to bioreactor operations: mathematical modeling and related experimental tools

Delvigne, F., Brognaux, A., Gorret, N., Sørensen, S. J., Michel, C. & Thonart, P., jul. 2011, Biosensors - Emerging Materials and Applications. Serra, P. A. (red.). Rijeka, Croatia: InTech, s. 601-630 30 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

Archaeal CRISPR-based immune systems: exchangeable functional modules

Garrett, R. A., Vestergaard, G. A. & Shah, S. A., nov. 2011, I: Trends in Microbiology. 19, 11, s. 549-56 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review

70 Citationer (Scopus)

Bias in bacterial diversity as a result of Nycodenz extraction from bulk soil

Holmsgaard, P. N., Norman, A., Hede, S. C., Poulsen, P. H. B., Al-Soud, W. A., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., okt. 2011, I: Soil Biology & Biochemistry. 43, 10, s. 2152-2159 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

35 Citationer (Scopus)

Biofilms in soil

Burmølle, M., Kjøller, A. H. & Sørensen, S. J., 2011, Encyclopedia of agrophysics. Springer, s. 70-75 6 s. (Encyclopedia of Earth Sciences Series).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Encyclopædiartikel › Forskning › peer review

24 Citationer (Scopus)

Characterization of bacterial populations in Danish raw milk cheeses made with different starter cultures by denaturating gradient gel electrophoresis and pyrosequencing

Masoud, W. M. H., Takamiya, M. K. W., Vogensen, F. K., Lillevang, S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, S. J. & Jakobsen, M., mar. 2011, I: International Dairy Journal. 21, 3, s. 142-148 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

126 Citationer (Scopus)

Characterization of pIC13_78, a biofilm enabling plasmid

Madsen, J. S., Norman, A., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2011.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

Comparative analysis of bacterial communities in a potato field as determined by pyrosequencing

Inceoglu, Ö., Abu Al-Soud, W., Salles, J. F., Semenov, A. V. & van Elsas, J. D., 1 aug. 2011, I: P L o S One. 6, 8, s. e23321 (1-10) 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

150 Citationer (Scopus)

603 Downloads (Pure)

Comparison of aerobic and anaerobic [³H]leucine incorporation assays for determining pollution-induced bacterial community tolerance in copper-polluted, irrigated soils

Aaen, K. N., Holm, P. E., Priemé, A., Hung, N. N. & Brandt, K. K., mar. 2011, I: Environmental Toxicology and Chemistry. 30, 3, s. 588-595 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

Construction of biosensors to investigate physiological diversity in fermentation processes

Han, S., Lundin, L. & Sørensen, S. J., 2011.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

Deletion of the topoisomerase III gene in the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus islandicus results in slow growth and defects in cell cycle control

Li, X., Guo, L., Deng, L., Feng, D., Ren, Y., Chu, Y., She, Q. & Huang, L., 20 jun. 2011, I: Journal of Genetics and Genomics. 38, 6, s. 253-9 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

11 Citationer (Scopus)

Design and Synthesis of a Quintessential Self-Transmissible IncX1 Plasmid, pX1.0

Hansen, L. H., Bentzon-Tilia, M., Bentzon-Tilia, S., Norman, A., Rafty, L. & Sørensen, S. J., maj 2011, I: P L o S One. 6, 5, 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

307 Downloads (Pure)

Diversity and characterization of mercury-resistant bacteria in snow, freshwater and sea-ice brine from the High Arctic

Møller, A., Barkay, T., Abu Al-Soud, W., Sørensen, S. J., Skov, H. & Kroer, N. A., 1 mar. 2011, I: F E M S Microbiology Ecology. 75, 3, s. 390-401 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

57 Citationer (Scopus)

Effects of elevated atmospheric CO₂, prolonged summer drought and temperature increase on N₂O and CH₄ fluxes in a temperate heathland

Carter, M. S., Ambus, P. L., Albert, K. R., Larsen, K. S., Andersson, M., Priemé, A., van der Linden, L. & Beier, C., aug. 2011, I: Soil Biology & Biochemistry. 43, 8, s. 1660-1670 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

25 Citationer (Scopus)

Effects of hot water extraction and fungal decay on wood crystalline cellulose structure

Howell, C., Hastrup, A. C. S., Jara, R., Larsen, F. H., Goodell, B. & Jellison, J., okt. 2011, I: Cellulose. 18, 5, s. 1179-1190 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

20 Citationer (Scopus)

4 Downloads (Pure)

Endolithic chlorophyll d-containing phototrophs

Behrendt, L., Larkum, A. W. D., Norman, A., Qvortrup, K., Chen, M., Ralph, P., Sørensen, S. J., Trampe, E. C. L. & Kühl, M., jun. 2011, I: I S M E Journal. 5, 6, s. 1072-6 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

53 Citationer (Scopus)

Experimental methods and modeling techniques for description of cell population heterogeneity

Lencastre Fernandes, R., Nierychlo, M., Lundin, L., Pedersen, A. E., Tellez, P. E. P., Dutta, A., Carlquist, M., Bolic, A., Schäpper, D., Brunetti, A. C., Helmark, S., Heins, A-L., Jensen, A. D., Nopens, I., Rottwitt, K., Szita, N., Elsas, J. D. V., Nielsen, P. H., Martinussen, J., Sørensen, S. J., & 2 flereEliasson Lantz, A. & Gernaey, K., nov. 2011, I: Biotechnology Advances. 29, 6, s. 575-599 25 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

80 Citationer (Scopus)

Extrachromosomal replicons:

Sørensen, S. J., 2011, Lewin's GENES X. Lewin, B., Krebs, J. E., Goldstein, E. S., Kilpatrick, S. T. & Goldstein, E. S. (red.). 10th ed udg. Sudbury, Mass. : Jones and Bartlett Publishers, s. 282-298 16 s. (Jones and Bartlett books in computer science).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Undervisning

Fluoroquinolone resistance mechanisms in urinary tract pathogenic Escherichia coli isolated during rapidly increasing fluoroquinolone consumption in a low-use country

Christiansen, N., Nielsen, L., Jakobsen, L., Stegger, M., Hansen, L. H. & Frimodt-Moller, N., 1 aug. 2011, I: Microbial Drug Resistance. 17, 3, s. 395-406 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

17 Citationer (Scopus)

Microbiology

Publikation

Søgeresultater