Microbiology

2009

Characterization of genetic determinants of extended-spectrum cephalosporinases (ESCs) in Escherichia coli isolates from Danish and imported poultry meat

Bergenholtz, R. D., Jørgensen, M. S., Hansen, L. H., Jensen, L. B. & Hasman, H., 2009, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 64, 1, s. 207-209 2 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

34 Citationer (Scopus)

Conjugative plasmids: Vessels of the communal gene pool

Norman, A., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2009, I: Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences. 364, 1527, s. 2275-2289 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review

265 Citationer (Scopus)

Construction and Use of Flow Cytometry Optimized Plasmid-Sensor Strains: Genomes in Flux

Bahl, M. I., Oregaard, G., Sørensen, S. J. & Hansen, L. H., 2009, Horizontal Gene Transfer. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 257-268 (Methods in Molecular Biology).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

5 Citationer (Scopus)

CRISPR families of the crenarchaeal genus Sulfolobus: bidirectional transcription and dynamic properties

Lillestøl, R. K., Shah, S. A., Brügger, K., Redder, P., Phan, H., Christiansen, J. & Garrett, R. A., 2009, I: Molecular Microbiology. 72, 1, s. 259-272

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

174 Citationer (Scopus)

Darwinian and demographic forces affecting human protein coding genes.

Nielsen, R., Hubisz, M. J., Hellmann, I., Torgerson, D., Andres, A. M., Albrechtsen, A., Gutenkunst, R., Adams, M. D., Cargill, M., Boyko, A., Indap, A., Bustamante, C. D. & Clark, A. G., 2009, I: Genome Research. 19, 5, s. 838-49 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

114 Citationer (Scopus)

Erratum: Genetic variant near IRS1 is associated with type 2 diabetes, insulin resistance and hyperinsulinemia (Nature Genetics) 41 (1110-1115)

Rung, J., Cauchi, S., Albrechtsen, A., Shen, L., Rocheleau, G., Cavalcanti-Proença, C., Bacot, F., Balkau, B., Belisle, A., Borch-Johnsen, K., Charpentier, G., Dina, C., Durand, E., Elliott, P., Hadjadj, S., Järvelin, M. R., Laitinen, J., Lauritzen, T., Marre, M., Mazur, A., & 20 flereMeyre, D., Montpetit, A., Pisinger, C., Posner, B., Poulsen, P., Pouta, A., Prentki, M., Ribel-Madsen, R., Ruokonen, A., Sandbaek, A., Serre, D., Tichet, J., Vaxillaire, M., Wojtaszewski, J. F. P., Vaag, A., Hansen, T., Polychronakos, C., Pedersen, O., Froguel, P. & Sladek, R., 1 okt. 2009, I: Nature Genetics. 41, 10, 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › peer review

Genera Orchidacearum: Epidendroideae (Part two)

Pridgeon, A. M. (red.), Cribb, P. J. (red.), Chase, M. W. & Rasmussen, F. N. (red.), 2009, Oxford: Oxford University Press. 586 s.

Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › peer review

Genetic Characterizations of IncX-plasmids of the Enterobacteriaceae

Norman, A., 2009, Biologisk Institut: Museum Tusculanum.

Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling

Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, L. H., Magid, J. & Sørensen, S. J., 2009. 1 s.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2009. 1 s.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

10 Downloads (Pure)

Line probe assay for differentiation within Mycobacterium tuberculosis complex. Evaluation on clinical specimens and isolates including Mycobacterium pinnipedii

Kjeldsen, M. K., Bek, D., Rasmussen, E. M., Priemé, A. & Thomsen, V. Ø., 2009, I: Scandinavian Journal of Infectious Diseases. 41, 9, s. 635-41 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

Mapping of HNF4alpha target genes in intestinal epithelial cells

Boyd, M., Bressendorff, S., Moller, J., Olsen, J. & Troelsen, J., 2009, I: BMC Gastroenterology. 9, 1, s. 68

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

53 Citationer (Scopus)

Microsatellite analysis of the natterjack toad (Bufo calamita) in Denmark: populations are islands in a fragmented landscape

Allentoft, M. E., Siegismund, H. R., Briggs, L. & Andersen, L. W., 2009, I: Conservation Genetics. 10, 1, s. 15-28

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

32 Citationer (Scopus)

Non-destructive sampling of ancient insect DNA

Thomsen, P. F., Elias, S., Gilbert, T., Haile, J., Munch, K., Kuzmina, S., Froese, D. G., Sher, A., Holdaway, R. N. & Willerslev, E., 2009, I: PLoS ONE. 4, 4, s. e5048

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

76 Citationer (Scopus)

2639 Downloads (Pure)

Orchid mycorrhiza: implications of a mycophagous life style

Rasmussen, H. N. & Rasmussen, F. N., 2009, I: Oikos. 118, 3, s. 334-345 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

144 Citationer (Scopus)

Persistence Mechanisms of Conjugative Plasmids

Bahl, M. I., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2009, Horizontal Gene Transfer: Genomes in Flux. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 73-102 (Methods in Molecular Biology).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

33 Citationer (Scopus)

Prevalence estimates of antibodies towards foot-and-mouth disease virus in small ruminants in Uganda

Balinda, S. N., Tjørnehøj, K., Muwanika, V. B., Sangula, A. K., Mwiine, F. N., Ayebazibwe, C., Masembe, C., Siegismund, H. R. & Alexandersen, S., 2009, I: Transboundary and Emerging Diseases. 56, 9-10, s. 362-371 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

40 Citationer (Scopus)

Radiation of extant Cetaceans Driven by Restructuring of the Oceans

Steeman, M. E., Hebsgaard, M. B., Fordyce, JE., Syw, H., Rabovsky, DL., Nielsen, R., Rahbek, C., Glenner, H., Sørensen, M. V. & Willerslev, E., 2009, I: Systematic Biology. 58, s. 573-585 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

238 Citationer (Scopus)

Relatedness mapping and tracts of relatedness for genome-wide data in the presence of linkage disequilibrium

Albrechtsen, A., Korneliussen, T. S., Moltke, I., van Overseem Hansen, T., Nielsen, F. C. & Nielsen, R., 2009, I: Genetic Epidemiology. 33, 3, s. 266-274

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

64 Citationer (Scopus)

Relationship between three measures of genetic differentiation G_ST, D_EST and G'_ST: how wrong have we been?

Heller, R. & Siegismund, H. R., 2009, I: Molecular Ecology. 18, 10, s. 2080-2083

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

139 Citationer (Scopus)

Retrotransposons and non-protein coding RNAs

Mourier, T. & Willerslev, E., 2009, I: Briefings in Functional Genomics and Proteomics.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

14 Citationer (Scopus)

Soil recovery after removal of the N₂-fixing invasive Acacia longifolia: consequences for ecosystem restoration

Marchante, E., Kjøller, A. H., Struwe, S. & Freitas, H., 2009, I: Biological Invasions. 11, 4, s. 813-823 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

87 Citationer (Scopus)

Temporal changes in wood crystalline cellulose during degradation by brown rot fungi

Howell, C., Hastrup, A. C. S., Goodell, B. & Jellison, J., 2009, I: International Biodeterioration and Biodegradation. 63, 4, s. 414-419

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

55 Citationer (Scopus)

The mitochondrial genome sequence of the Tasmanian tiger (Thylacinus cynocephalus)

Miller, W., Drautz, D. I., Janecka, J. E., Lesk, A. M., Ratan, A., Tomsho, L. P., Packard, M., Zhang, Y., McClellan, L. R., Qi, J., Zhao, F., Gilbert, M. T. P., Dalén, L., Arsuaga, J. L., Ericson, P. G. P., Huson, D. H., Helgen, K. M., Murphy, W. J., Götherström, A. & Schuster, S. C., 2009, I: Genome Research. 19, 2, s. 213-20 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

90 Citationer (Scopus)

The presence of embedded bacterial pure cultures in agar plates stimulate the culturability of soil bacteria.

Burmølle, M., Johnsen, K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2009, I: Journal of Microbiological Methods. 79, 2, s. 166-173 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

The serine protease Esperase HPF inhibits the formation of multispecies biofilm

Hangler, M., Burmølle, M., Schneider, I., Allermann, K. & Jensen, B., 2009, I: Biofouling. 25, 7, s. 667-674 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

23 Citationer (Scopus)

The validation and assessment of machine learning: a game of prediction from high-dimensional data

Pers, T. H., Albrechtsen, A., Holst, C., Sørensen, T. I. A. & Gerds, T. A., 2009, I: PLoS ONE. 4, 8, s. e6287

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

21 Citationer (Scopus)

Very Old DNA

Hebsgaard, M. B. & Willerslev, E., 2009, Permafrost Soils. Margesin, R. (red.). Springer, Bind 16. s. 47-59 (Soil Biology, Bind 16).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

Where sociality and relatedness diverge: the genetic basis for hierarchical social organization in African elephants

Wittemyer, G., Okello, J. B. A., Rasmussen, H. B., Arctander, P., Nyakaana, S., Douglas-Hamilton, I. & Siegismund, H. R., 2009, I: PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY OF LONDON SERIES B-CONTAINING PAPERS OF A BIOLOGICAL CHARACTER. 276, 1672, s. 3513-3521

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

44 Citationer (Scopus)

2008

Acclimation of subsurface microbial communities to mercury

de Lipthay, J. R., Rasmussen, L. D., Øregaard, G., Simonsen, K., Bahl, M. I., Kroer, N. & Sørensen, S. J., 2008, I: FEMS Microbiology Ecology. 65, 1, s. 145-55 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

16 Citationer (Scopus)

Age- and tactic-related paternity success in male African elephants

Rasmussen, H. B., Okello, J. B. A., Wittemyer, G., Siegismund, H. R., Arctander, P., Vollrath, F. & Douglas-Hamilton, I., 2008, I: Behavioral Ecology. 19, 1, s. 9-15

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

45 Citationer (Scopus)

Anbragte børn i Danmark: en deskriptiv analyse

Ejrnæs, M., Ejrnæs, N. M. & Frederiksen, S. E., 2008, Institut for Sociologi, Socialt Arbejde og Organisation, Aalborg Universitet, 81 s.

Publikation: Working paper › Forskning

Ancient DNA- Practical and theoretical issues

Hebsgaard, M. B., 2008

Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling

Assessing the evolutionary impact of amino acid mutations in the human genome

Boyko, A. R., Williamson, S. H., Indap, A. R., Degenhardt, J. D., Hernandez, R. D., Lohmueller, K. E., Adams, M. D., Schmidt, S., Sninsky, J. J., Sunyaev, S. R., White, T. J., Nielsen, R., Clark, A. G. & Bustamante, C. D., 2008, I: PLoS Genetics. 4, 5, s. e1000083

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

392 Citationer (Scopus)

Bacteria in Mercury Contaminated Soil and Horizontal gene Transfer

Øregaard, G., 2008, Department of Biology.

Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling

Barking up the wrong tree: modern northern European dogs fail to explain their origin.

Malmström, H., Vilà, C., Gilbert, M. T. P., Storå, J., Willerslev, E., Holmlund, G. & Götherström, A., 2008, I: BMC Evolutionary Biology. 8, s. 71

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

22 Citationer (Scopus)

Broad phylogenomic sampling improves resolution of the animal tree of life

Dunn, C. W., Hejnol, A., Matus, D. Q., Pang, K., Browne, W. E., Smith, S. A., Seaver, E., Rouse, G. W., Obst, M., Edgecombe, G. D., Sørensen, M. V., Haddock, S. H. D., Schmidt-Rhaesa, A., Okuso, A., Kristensen, R. M., Wheeler, W. C., Martindale, M. Q. & Giribet, G., 2008, I: Nature. 452, s. 745-750

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1382 Citationer (Scopus)

Characterisation, dissemination and persistence of gentamicin resistant Escherichia coli from a Danish university hospital to the waste water environment

Jakobsen, L., Sandvang, D., Hansen, L. H., Bagger-Skjøt, L., Westh, H., Jørgensen, C., Hansen, D. S., Pedersen, B. M., Monnet, D. L., Frimodt-Møller, N., Sørensen, S. J. & Hammerum, A. M., 2008, I: Environment International. 34, 1, s. 108-15 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

51 Citationer (Scopus)

CLIMAITE - a three factor climate change ecosystem manipulation experiment: Geophysical Research Abstracts, Vol. 10, EGU2008-A-07931, 2008. SRef-ID: 1607-7962/gra/EGU2008-A-07931. EGU General Assembly 13-18 April 2008 in Vienna, Switzerland

N. Mikkelsen, T., Beier, C., Jonasson, S. E., Holmstrup, M., Schmidt, I. K., Ambus, P. L., Pilegaard, K., Michelsen, A., Albert, K., Andresen, L. C., Arndal, M. F., Bruun, N., Christensen, S., Danbæk, S., Gundersen, P., Jørgensen, P., J. Linden, L., Pedersen, J. K., Maraldo, K., Priemé, A., & 11 flereRiis-Nielsen, T., Ro-Poulsen, H., Andersen, K. S., Selsted, M., Sørensen, P., S. Larsen, K., S. Carter, M., Ibrom, A., Martinussen, T., Miglietta, F. & Sverdrup, H., 2008.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

Comment on "Protein Sequences from Mastodon and Tyrannosaurus rex Revealed by Mass Spectrometry".

Buckley, M., Walker, A., Ho, S. Y. W., Yang, Y., Smith, C., Ashton, P., Oates, J. T., Cappellini, E., Koon, H., Penkman, K., Elsworth, B., Ashford, D., Solazzo, C., Andrews, P., Strahler, J., Shapiro, B., Ostrom, P., Gandhi, H., Miller, W., Raney, B., & 8 flereZylber, M. I., Gilbert, M. T. P., Prigodich, R. V., Ryan, M., Rijsdijk, K. F., Janoo, A., Collins, M. J. & Gilbert, M. T. P., 2008, I: Science. 319, 5859, s. 33

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

67 Citationer (Scopus)

Cultivation of hard-to-culture subsurface mercury-resistant bacteria and discovery of new merA gene sequences

Rasmussen, L. D., Zawadsky, C., Binnerup, S. J., Øregaard, G., Sørensen, S. J. & Kroer, N., 2008, I: Applied and Environmental Microbiology. 74, 12, s. 3795-803 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

35 Citationer (Scopus)

Denitrification rate determined by nitrate disapperance is higher than determined by nitrous oxide production with acetylene blockage

Yu, K., Struwe, S., Kjøller, A. & Chen, G., 2008, I: Ecological Engineering: The Journal of Ecotechnology. 32, 1, s. 90-96 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

19 Citationer (Scopus)

Direct evidence of extensive diversity of HIV-1 in Kinshasa by 1960

Worobey, M., Gemmel, M., Teuwen, D. E., Haselkorn, T., Kunstman, K., Bunce, M., Muyembe, J-J., Kabongo, J-M. M., Kalengayi, R. M., Van Marck, E., Gilbert, M. T. P. & Wolinsky, S. M., 2008, I: Nature. 455, 7213, s. 661-4 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

371 Citationer (Scopus)

DNA from Pre-Clovis Human Coprolites in Oregon, North America.

Gilbert, M. T. P., Jenkins, D. L., Götherstrom, A., Naveran, N., Sanchez, J. J., Hofreiter, M., Thomsen, P. F., Binladen, J., Higham, T. F. G., Yohe, R. M., Parr, R., Cummings, L. S. & Willerslev, E., 2008, I: Science. 320, 5877, s. 786 - 789

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

259 Citationer (Scopus)

Does selection against transcriptional interference shape retroelement-free regions in mammalian genomes?

Mourier, T. & Willerslev, E., 2008, I: PLoS ONE. s. e3760

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

Effective population size dynamics reveal impacts of historic climatic events and recent anthropogenic pressure in African elephants

Okello, J. B. A., Wittemyer, G., Rasmussen, H. B., Arctander, P., Nyakaana, S., Douglas-Hamilton, I. & Siegismund, H. R., 2008, I: Molecular Ecology. 17, 17, s. 3788-3799 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

40 Citationer (Scopus)

Endocrine and behavioral changes in male african elephants: Linking hormone changes to sexual state and reproductive tactics

Rasmussen, H. B., Ganswindt, A., Douglas-Hamilton, I. & Vollrath, F., 2008, I: Hormones and Behavior. 54, s. 539-548

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

32 Citationer (Scopus)

En rig natur i fremtidens samfund

Geldmann, J. & Skouw-Rasmussen, M., 2008, I: Aktuel Naturvidenskab. 1, s. 34-35 2 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

Estimation of 2N(e)s from temporal allele frequency data

Bollback, J. P., York, T. L. & Nielsen, R., 2008, I: Genetics. 179, s. 497-502 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

87 Citationer (Scopus)

Experimental design of multifactor climate change experiments with elevated CO₂, warming and drought: the CLIMAITE project

Mikkelsen, T. N., Beier, C., Jonasson, S. E., Holmstrup, M., Schmidt, I. K., Ambus, P. L., Pilegaard, K., Michelsen, A., Albert, K., Andresen, L. C., Arndal, M. F., Bruun, N., Christensen, S., Danbæk, S., Gundersen, P., Jørgensen, P., Linden, L., Nielsen, J. K., Maraldo, K., Priemé, A., & 11 flereRiis-Nielsen, T., Ro-Poulsen, H., Andersen, K. S., Selsted, M. B., Sørensen, P., Larsen, K. S., Carter, M. S., Ibrom, A., Martinussen, T., Miglietta, F. & Sverdrup, H., 2008, I: Functional Ecology. 22, 1, s. 185-195 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

117 Citationer (Scopus)

171 Downloads (Pure)

Microbiology

Publikation

Søgeresultater