Jonas Andreas Sibbesen

2018

Accurate genotyping across variant classes and lengths using variant graphs

Sibbesen, J. A., Maretty, L., Krogh, A., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Guo, X., Hansen, T., Krogh, A., Sørensen, T. I. A., Pedersen, O. B., Wang, J. & Brunak, S., 1 jul. 2018, I: Nature Genetics. 50, s. 1054-1059 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

15 Citationer (Scopus)

Benchmarking the HLA typing performance of Polysolver and Optitype in 50 Danish parental trios

Matey-Hernandez, M. L., Danish Pan Genome Consortium, Brunak, S., Izarzugaza, J. M. G., Sørensen, L. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Belling, K. G., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Sun, J., Hansen, T., Krogh, A., Sørensen, T. I. A., Pedersen, O. B., Wang, J., Eiberg, H. R. L. & Kristiansen, K., 2018, I: BMC Bioinformatics. 19, s. 1-12 239.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

69 Downloads (Pure)

2017

Analysis of 62 hybrid assembled human Y chromosomes exposes rapid structural changes and high rates of gene conversion

Danish Pan Genome Consortium, Sørensen, L. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Belling, K. G., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Hansen, T., Krogh, A., Sørensen, T. I. A., Pedersen, O. B., Rasmussen, S., Kristiansen, K. & Brunak, S., aug. 2017, I: PLOS Genetics. 13, 8, s. e1006834

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

15 Citationer (Scopus)

Assembly and analysis of 100 full MHC haplotypes from the Danish population

Jensen, J. M., Villesen, P., Friborg, R. M., Mailund, T., Besenbacher, S., Sørensen, L. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y. & Xu, R. & 39 flere, Ye, W., Rao, J., Guo, X., Sun, J., Cao, H., Ye, C., Beusekom, J. V., Espeseth, T., Flindt, E., Halager, A. E., Hellard, S. L., Hultman, C. M., Lescai, F., Li, S., Lund, O., Løngren, P., Matey-Hernandez, M. L., Mors, O., Pedersen, C. N. S., Sicheritz-Pontén, T., Sullivan, P., Syed, A., Westergaard, D., Yadav, R., Li, N., Xu, X., Hansen, T., Bolund, L., Krogh, A., Sørensen, T. I. A., Pedersen, O. B., Gupta, R., Rasmussen, S., Børglum, A. D., Wang, J., Eiberg, H. R. L., Kristiansen, K., Brunak, S. & Schierup, M. H., sep. 2017, I: Genome Research. 27, 9, s. 1597-1607 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

150 Downloads (Pure)

Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference

Sørensen, L. M., Jensen, J. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Villesen, P., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R., Ye, W., Rao, J. & Guo, X. & 39 flere, Sun, J., Cao, H., Ye, C., van Beusekom, J., Espeseth, T., Flindt, E., Friborg, R. M., Halager, A. E., Le Hellard, S., Hultman, C. M., Lescai, F., Li, S., Lund, O., Løngren, P., Mailund, T., Matey-Hernandez, M. L., Mors, O., Pedersen, C. N. S., Sicheritz-Pontén, T., Sullivan, P., Syed, A., Westergaard, D., Yadav, R., Li, N., Xu, X., Hansen, T., Krogh, A., Bolund, L., Sørensen, T. I. A., Pedersen, O. B., Gupta, R., Rasmussen, S., Besenbacher, S., Børglum, A. D., Wang, J., Eiberg, H. R. L., Kristiansen, K., Brunak, S. & Schierup, M. H., 3 aug. 2017, I: Nature. 548, 7665, s. 87-91 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › peer review

52 Citationer (Scopus)

291 Downloads (Pure)

2016

Coalescent inference using serially sampled, high-throughput sequencing data from intrahost HIV infection

Dialdestoro, K., Sibbesen, J. A., Sørensen, L. M., Raghwani, J., Gall, A., Kellam, P., Pybus, O. G., Hein, J. & Jenkins, P. A., apr. 2016, I: Genetics (Print). 202, 4, s. 1449-1472 24 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

9 Citationer (Scopus)

Next-generation biology: sequencing and data analysis approaches for non-model organisms

Rodrigues da Fonseca, R. A., Albrechtsen, A., Themudo, G. E. C., Ramos Madrigal, J., Sibbesen, J. A., Sørensen, L. M., Zepeda Mendoza, M. L., Campos, P., Heller, R. & Pereira, R., 1 dec. 2016, I: Marine Genomics. 30, s. 3-13

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

70 Citationer (Scopus)

131 Downloads (Pure)

Probabilistic Transcriptome Assembly and Variant Graph Genotyping

Sibbesen, J. A., 2016, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 119 s.

Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling

RNA sequencing of trigeminal ganglia in Rattus Norvegicus after glyceryl trinitrate infusion with relevance to migraine

Pedersen, S. H., Sørensen, L. M., Ramachandran, R., Sibbesen, J. A., Yakimov, V., Christensen, R. E., Hansen, T. F., Krogh, A., Olesen, J. & Olesen, I. J., 1 maj 2016, I: P L o S One. 11, 5, 13 s., e0155039.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

6 Citationer (Scopus)

74 Downloads (Pure)

2014

Bayesian transcriptome assembly

Sørensen, L. M., Sibbesen, J. A. & Krogh, A., 31 okt. 2014, I: Genome Biology (Online Edition). 15, 10, 11 s., 501.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

23 Citationer (Scopus)

1054 Downloads (Pure)

Jonas Andreas Sibbesen

Publikation

Søgeresultater