Publikationer pr. år
Publikationer pr. år
Personlig profil
Kort præsentation
Primære forskningsområder
Mit fokus indenfor forskning er DNA-sekventeringsmetoder. Denne teknik har mange navne og er ofte kendt som anden-generationssekventering, next generation sequencing (NGS), second generation sequencing (SGS), massively parallel sequencing (MPS) og high throughput sequencing (HTS).
DNA-sekventering anvendes til at undersøge detaljer og ændringer i DNA for at forstå, hvad de ændringer medfører. Jeg har desuden specialiseret mig indenfor epigenetikken, hvor man undersøger de små modifikationer, som ses når gener udtrykkes.
Jeg har, fra tidligere forskningsprojekter, stor erfaring med at arbejde med meget små mængder af DNA og RNA. Herfra har jeg flerårig ekspertise med brugen af molekylær capture, hvor man fisker meget små mængder DNA eller RNA ud og frasorterer det DNA eller RNA af interesse.
Nøgleord
Genetik, epigenetik, NGS, DNA, RNA, retsmedicin, retsgenetik, sekventering, skizofreni, methylering.
CV
Tidligere stilling
|
Titel |
Post.doc |
|
Forskningsfelt |
Identifikation af pattedyr og forskellige virussygdomme fra blodsugende igler samlet i regnskoven i Sydøstasien ved hjælp af molekylær capture- og NGS-metoder |
|
Lokation |
Junior Research Group: Southeast Asian Biodiversity and Biogeography, Leibniz Institute for Zoo and Wildlife Research, Berlin, Germany |
|
Arbejdsgiver |
Dr. Andreas Wilting |
|
Tidsramme |
August 2013 – September 2014 |
Uddannelse
|
Titel |
PhD. kandidat |
|
Titel på afhandling |
Molekylære teknikker for at karakterisere patogener: molekylær capture, NGS og massespektrometri |
|
Lokation |
Center for GeoGenetik, Københavns Universitet, Danmark |
|
Vejledere |
Prof. M. Thomas P. Gilbert og Prof. Lars Peter Nielsen |
|
Tidsramme |
Juni 2010 – Juni 2013 (Forsvaret 4. oktober 2013). |
|
Titel |
Besøgende PhD. kandidat |
|
Forskningsfelt |
Molekylær capture af herpesvirus fra forskellige typer væv |
|
Lokation |
Department of Wildlife Diseases, Leibniz Institute for Zoo and Wildlife Research, Berlin, Germany. |
|
Vejleder |
Prof. Alex D. Greenwood |
|
Tidsramme |
November 2012 – Marts 2013 |
|
Titel |
Cand.polyt |
|
Specialisering |
Bioteknologi i medicinsk mikrobiologi |
|
Lokation |
Danmark Tekniske Universitet (DTU), Danmark |
|
Tidsramme |
Januar 2008 – April 2010 |
|
Titel |
Master of Science |
|
Forskningsfelt |
Life Sciences |
|
Lokation |
Technical University of Delft, The Netherlands |
|
Tidsramme |
Januar 2009 – Juli 2009 |
|
Titel |
Bachelor i ingeniørvidenskab |
|
Specialisering |
Bioteknologi |
|
Lokation |
Danmark Tekniske Universitet (DTU), Danmark |
|
Tidsramme |
September 2004 – Januar 2008 |
Courses
|
Titel |
IonTorrent PGM™ Instrument Training |
|
Primære fokus |
Praktisk erfaring med biblioteksbygning og forberedelse til IonTorrent OneTouch sammen med opsættelsen af IonTorrent PGM sekventeringsmaskinen og databehandling |
|
Lokation |
Life Technologies, Darmstadt, Tyskland |
|
Organisatorer |
Life Technologies, Nathalie Kefer og Elena Fenino. |
|
Tidsramme |
August 2013 |
|
Titel |
Next Generation Sequencing Data Management |
|
Primære fokus |
Databehandling til Illumina-data ved hjælp af de novo-redskaber |
|
Lokation |
The Gulbenkian Training Programme in Bioinformatics, Oeiras, Portugal |
|
Organisator |
Pedro Fernandes |
|
Tidsramme |
Maj 2011 |
|
Titel |
Workshop on Molecular Evolution |
|
Primære fokus |
Databenhandling til at producere fylogenetiske træer fra NGS-data. |
|
Lokation |
Cesky Krumlov, Tjekkiet |
|
Organisator |
Michael Cummings |
|
Tidsramme |
Januar 2011 |
|
Titel |
Writers Development |
|
Primære fokus |
Redskaber til at forbedre den videnskabelige skriveproces |
|
Lokation |
Københavns Universitet, Danmark |
|
Organisator |
Sarah Haas |
|
Tidsramme |
December 2010 |
|
Titel |
Introduktion til universitetspædagogik |
|
Primære fokus |
Redskaber til at forbedre undervisningen på universiteterne |
|
Lokation |
Københavns Universitet, Danmark |
|
Organisator |
Frederik V. Christensen |
|
Tidsramme |
Oktober 2010 |
Eksterne ansættelser
Leibniz Institute for Zoo and Wildlife Research
1 aug. 2013 → 31 aug. 2014
Emneord
- Det Natur- og Biovidenskabelige Fakultet
Fingeraftryk
Dyk ned i forskningsemnerne, hvor Marie-Louise Kampmann er aktive. Disse emneetiketter kommer fra dennes persons arbejder. Sammen danner de et unikt fingerprint.
- 6 Lignende profiler
-
Hybridization capture using short PCR products enriches small genomes by Capturing Flanking Sequences (CapFlank)
Tsangaras, K., Wales, N., Sicheritz-Pontén, T., Rasmussen, S., Michaux, J., Ishida, Y., Morand, S., Kampmann, M.-L., Gilbert, M. T. P. & Greenwood, A. D., 2 okt. 2014, I: PLoS ONE. 9, 10, 10 s., e109101.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
Comparison of techniques for quantification of next-generation sequencing libraries
Hussing, C., Kampmann, M.-L., Mogensen, H. S., Børsting, C. & Morling, N., 1 dec. 2015, I: Forensic Science International: Genetics. Supplement Series. 5, s. e276-e278 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › peer review
-
High-throughput sequencing of forensic genetic samples using punches of FTA cards with buccal swabs
Kampmann, M.-L., Buchard, A., Børsting, C. & Morling, N., sep. 2016, I: BioTechniques. 61, 3, s. 149-151 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
ISO 17025 validation of a next-generation sequencing assay for relationship testing
Buchard, A., Kampmann, M.-L., Poulsen, L., Børsting, C. & Morling, N., 1 okt. 2016, I: Electrophoresis. 37, 21, s. 2822-2831 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
Leeches as a source of mammalian viral DNA and RNA - a study in medicinal leeches
Kampmann, M.-L., Schnell, I. B., Jensen, R. H., Axtner, J., Pedersen, A. F. S., Hansen, A. J., Bertelsen, M. F., Greenwood, A. D., Gilbert, T. & Wilting, A., 1 apr. 2017, I: European Journal of Wildlife Research. 63, 6 s., 36.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › peer review
-
A simple method for the parallel deep sequencing of full influenza A genomes
Kampmann, M.-L., Fordyce, S. L., Avila Arcos, M. D. C., Rasmussen, M., Willerslev, E., Nielsen, L. P. & Gilbert, T., dec. 2011, I: Journal of Virological Methods. 178, 1-2, s. 243-248 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › peer review
-
Non-invasive prenatal paternity testing using a standard forensic genetic massively parallel sequencing assay for amplification of human identification SNPs
Christiansen, S. L., Jakobsen, B., Børsting, C., Udengaard, H., Buchard, A., Kampmann, M.-L., Grøndahl, M. L. & Morling, N., 1 sep. 2019, I: International Journal of Legal Medicine. 133, 5, s. 1361–1368Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
Sequencing Library Preparation from Degraded Samples for Non-illumina Sequencing Platforms
Martins, R. F., Kampmann, M. L. & Förster, D. W., 2019, Ancient DNA: Methods and Protocols. Humana Press, s. 85-92 (Methods in Molecular Biology, Bind 1963).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review