Kim Sneppen

2019

Applying allometric scaling to predator-prey systems

Eilersen, A. & Sneppen, K., 8 feb. 2019, I: Physical Review E. 99, 2, 8 s., 022405.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

3 Citationer (Scopus)

Exploring the contribution of exposure heterogeneity to the cessation of the 2014 Ebola epidemic

Uekermann, F., Simonsen, L. & Sneppen, K., 1 feb. 2019, I: PLoS ONE. 14, 2, 11 s., e0210638.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review

30 Downloads (Pure)

Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli

Pedersen, S., Terkelsen, T. B., Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, K. & Mitarai, N., 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

Multi stability and global bifurcations in epidemic model with distributed delay SIRnS-model

Jensen, G. G., Uekermann, F. & Sneppen, K., 1 feb. 2019, I: European Physical Journal B. 92, 2, 28.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

Self-assembly, buckling and density-invariant growth of three-dimensional vascular networks

Kirkegaard, J. B., Nielsen, B. F., Trusina, A. & Sneppen, K., 1 okt. 2019, I: Journal of the Royal Society. Interface. 16, 159, 8 s., 20190517.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

Theoretical analysis of Polycomb-Trithorax systems predicts that poised chromatin is bistable and not bivalent

Sneppen, K. & Ringrose, L., 1 dec. 2019, I: Nature Communications. 10, 18 s., 2133.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

16 Citationer (Scopus)

26 Downloads (Pure)

2018

Deconstructing the principles of ductal network formation in the pancreas

Dahl-Jensen, S. B., Yennek, S., Flasse, L., Larsen, H. L., Sever, D., Karremore, G., Novak, I., Sneppen, K. & Botton, A., 26 jul. 2018, I: PLOS Biology. 16, 7, 25 s., e2002842.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

80 Downloads (Pure)

Exploring the Link between Nucleosome Occupancy and DNA Methylation

Lövkvist, C. E., Sneppen, K. & Härter, J. O. M., 12 jan. 2018, I: Frontiers in Genetics. 8, 7 s., 232.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

Globalization in a nutshell

Sneppen, K. & Bornholdt, S., 29 okt. 2018, I: Physical Review E. 98, 4, 6 s., 022314.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Theoretical tool bridging cell polarities with development of robust morphologies

Nissen, S. B., Rønhild, S., Trusina, A. & Sneppen, K., 1 nov. 2018, I: eLife. 7, 25 s., e38407.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

125 Downloads (Pure)

Theory of invasion extinction dynamics in minimal food webs

Haerter, J. O., Mitarai, N. & Sneppen, K., 12 feb. 2018, I: Physical Review E. 97, 2, 10 s., 022404.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

2017

A growing microcolony can survive and support persistent propagation of virulent phages

Eriksen, R. S., Svenningsen, S. L., Sneppen, K. & Mitarai, N., 9 jan. 2017, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 2, s. 337-342

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

18 Citationer (Scopus)

Efficient chromosomal-scale DNA looping in Escherichia coli using multiple DNA-looping elements

Hao, N., Sneppen, K., Shearwin, K. E. & Dodd, I. B., 19 maj 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 9, s. 5074-5085

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

5 Citationer (Scopus)

53 Downloads (Pure)

Existence and construction of large stable food webs

Haerter, J. O., Mitarai, N. & Sneppen, K., 8 sep. 2017, I: Physical Review E. 96, 3, 032406.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

2 Citationer (Scopus)

Four simple rules that are sufficient to generate the mammalian blastocyst

Nissen, S. B., Perera Pérez, M., Martin Gonzalez, J., Morgani, S. M. C., Jensen, M. H., Sneppen, K., Brickman, J. M. & Trusina, A., 12 jul. 2017, I: PLOS Biology. 15, 7, s. 1-30 e2000737.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

22 Citationer (Scopus)

115 Downloads (Pure)

Models of life: epigenetics, diversity and cycles

Sneppen, K., 13 mar. 2017, I: Reports on Progress in Physics. 80, 4, 042601.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

Occlusion of the ribosome binding site connects the translational initiation frequency, mRNA stability and premature transcription termination

Eriksen, M., Sneppen, K., Pedersen, S. & Mitarai, N., 14 mar. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 7 s., 362.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

9 Citationer (Scopus)

72 Downloads (Pure)

Population cycles and species diversity in dynamic Kill-the-Winner model of microbial ecosystems

Maslov, S. & Sneppen, K., 4 jan. 2017, I: Scientific Reports. 7, 39642.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

32 Citationer (Scopus)

46 Downloads (Pure)

Severe population collapses and species extinctions in multihost epidemic dynamics

Maslov, S. & Sneppen, K., 22 aug. 2017, I: Physical Review E. 96, 2, 022412.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

2016

A cross-immunization model for the extinction of old influenza strains

Uekermann, F. & Sneppen, K., 13 maj 2016, I: Scientific Reports. 6, 8 s., 25907.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

2 Citationer (Scopus)

64 Downloads (Pure)

Diffusion retardation by binding of tobramycin in an alginate biofilm model

Cao, B., Christophersen, L., Kolpen, M., Jensen, P. Ø., Sneppen, K., Høiby, N., Moser, C. & Sams, T., 21 apr. 2016, I: P L o S One. 11, 4, 11 s., e0153616.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

19 Citationer (Scopus)

147 Downloads (Pure)

DNA methylation in human epigenomes depends on local topology of CpG sites

Lövkvist, C. E., Dodd, I. B., Sneppen, K. & Härter, J. O. M., 20 jun. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 11, s. 5123-5132

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

70 Citationer (Scopus)

Food Web Assembly Rules for Generalized Lotka-Volterra Equations

Härter, J. O. M., Mitarai, N. & Sneppen, K., feb. 2016, I: PLoS Computational Biology. 12, 2, e1004727.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

16 Citationer (Scopus)

110 Downloads (Pure)

Nanog, Oct4 and Tet1 interplay in establishing pluripotency

Olariu, V., Lövkvist, C. E. & Sneppen, K., 5 maj 2016, I: Scientific Reports. 6, 25438.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

33 Citationer (Scopus)

76 Downloads (Pure)

Nucleation and spreading of a heterochromatic domain in fission yeast

Obersriebnig, M. J., Pallesen, E. M. H., Sneppen, K., Trusina, A. & Thon, G., 11 maj 2016, I: Nature Communications. 7, 11 s., 11518.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

24 Citationer (Scopus)

143 Downloads (Pure)

Nucleosome dynamics and maintenance of epigenetic states of CpG islands

Sneppen, K. & Dodd, I. B., 28 jun. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 6, 062417.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

Population Dynamics of Phage and Bacteria in Spatially Structured Habitats Using Phage lambda and Escherichia coli

Mitarai, N., Brown, S. & Sneppen, K., 1 jun. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 12, s. 1783-1793

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

12 Citationer (Scopus)

Rapid Curtailing of the Stringent Response by Toxin-Antitoxin Encoded mRNases

Tian, C., Roghanian, M., Jørgensen, M. G., Sneppen, K., Sørensen, M. A., Gerdes, K. & Mitarai, N., jul. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 14, s. 1918-1926

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

17 Citationer (Scopus)

Short-range growth inhibitory signals from the epithelium can drive non-stereotypic branching in the pancreas

Steffensen, S. B., Figueiredo-Larsen, E. M., Botton, A. & Sneppen, K., 23 feb. 2016, I: Physical Biology. 13, 1, 016007.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

10 Citationer (Scopus)

Stabilization of epigenetic states of CpG islands by local cooperation

Sormani, G., Härter, J. O. M., Lövkvist, C. E. & Sneppen, K., 2016, I: Molecular BioSystems. 12, 7, s. 2142-2146

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

Three is much more than two in coarsening dynamics of cyclic competitions

Mitarai, N., Gunnarson, I., Pedersen, B. N., Rosiek, C. A. & Sneppen, K., 12 apr. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 042408.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

6 Citationer (Scopus)

2015

Cooperative stabilization of the SIR complex provides robust epigenetic memory in a model of SIR silencing in Saccharomyces cerevisiae

Sneppen, K. & Dodd, I. B., 1 apr. 2015, I: Epigenetics. 10, 4, s. 293-302

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

8 Citationer (Scopus)

59 Downloads (Pure)

Diversity Waves in Collapse-Driven Population Dynamics

Maslov, S. & Sneppen, K., 1 sep. 2015, I: P L o S One. 11, 9, e1004440.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

4 Citationer (Scopus)

78 Downloads (Pure)

Dynamic competition between transcription initiation and repression: Role of nonequilibrium steps in cell-to-cell heterogeneity

Mitarai, N., Semsey, S. & Sneppen, K., 13 aug. 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 2, 022710.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

Restriction modification systems as engines of diversity

Sneppen, K., Semsey, S., Seshasayee, A. S. N. & Krishna, S., 2 jun. 2015, I: Frontiers in Microbiology. 6, 528.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

15 Citationer (Scopus)

52 Downloads (Pure)

Well-temperate phage: optimal bet-hedging against local environmental collapses

Maslov, S. & Sneppen, K., 2 jun. 2015, I: Scientific Reports. 5, 10523.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

29 Citationer (Scopus)

52 Downloads (Pure)

2014

Collaboration between CpG sites is needed for stable somatic inheritance of DNA methylation states

Härter, J. O. M., Loevkvist, C., Dodd, I. B. & Sneppen, K., 1 feb. 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, 4, s. 2235-2244

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

40 Citationer (Scopus)

Effect of supercoiling on the λ switch

Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, K., Nielsen, P. E., Brown, S. & Oddershede, L. B., 1 jan. 2014, I: Bacteriophage. 4, 2, s. 1-5 5 s., e27517.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Mismatch repair at stop codons is directed independent of GATC methylation on the Escherichia coli chromosome

Sneppen, K. & Semsey, S., 5 dec. 2014, I: Scientific Reports. 4, 7436.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

6 Citationer (Scopus)

Modeling rises and falls in money addicted social hierarchies

Dybiec, B., Mitarai, N. & Sneppen, K., 2014, I: Physica Scripta. 89, 8, 085002.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

2 Citationer (Scopus)

Models of life: Dynamics and regulation in biological systems

Sneppen, K., 5 okt. 2014, Cambridge University Press udg. Cambridge. 342 s.

Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › peer review

Phage and bacteria support mutual diversity in a narrowing staircase of coexistence

Härter, J. O. M., Mitarai, N. & Sneppen, K., 25 nov. 2014, I: I S M E Journal. 28, 11, s. 2317-2326

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

35 Citationer (Scopus)

Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space

Mitarai, N., Heinsalu, E. & Sneppen, K., 12 maj 2014, I: PloS One. 9, 5, s. e96665

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

629 Downloads (Pure)

2013

Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy

Cataudella, I., Sneppen, K., Gerdes, K. & Mitarai, N., 1 aug. 2013, I: PLoS Computational Biology. 9, 8, e1003174.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

43 Citationer (Scopus)

1353 Downloads (Pure)

Differentiation of developing olfactory neurons analysed in terms of coupled epigenetic landscapes

Alsing, A. & Sneppen, K., 1 maj 2013, I: Nucleic Acids Research. 41, 9, 4755-4764.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

12 Citationer (Scopus)

DNA supercoiling enhances cooperativity and efficiency of an epigenetic switch

Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, K., Nielsen, P. E., Brown, S. & Oddershede, L. B., 22 okt. 2013, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 110, 43, s. 17386-91 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

26 Citationer (Scopus)

Genetic Regulatory Networks that count to 3

Lehmann, M. & Sneppen, K., 1 jul. 2013, I: Journal of Theoretical Biology. 329, s. 15-19 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

3 Citationer (Scopus)

Labyrinthine clustering in a spatial rock-paper-scissors ecosystem

Juul, J. S., Sneppen, K. & Mathiesen, J., 8 apr. 2013, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 87, 4, s. 042702 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

26 Citationer (Scopus)

Quality control system response to stochastic growth of amyloid fibrils

Pigolotti, S., Lizana, L., Sneppen, K. & Otzen, D., 2 maj 2013, I: F E B S Letters. 587, 9, s. 1405-1410 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

2012

A simple histone code opens many paths to epigenetics

Sneppen, K. & Dodd, I. B., aug. 2012, I: P L o S Computational Biology. 8, 8, 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

31 Citationer (Scopus)

Kim Sneppen

Publikation

Søgeresultater