Jacob Wium Bjerrum

Publikation

Publikationer pr. år 2006 2007 2010 2013 2014 2019

• 19 Tidsskriftartikel
• 2 Review
• 1 Ph.d.-afhandling
• 1 Bidrag til bog/antologi
• 1 Mere
  • 1 Leder

Publikationer pr. år

Publikationer pr. år

Søgeresultater

• 2019

  Metabonomics in gastroenterology and hepatology

  Bjerrum, J. T. & Nielsen, O. H., 1 aug. 2019, I: International Journal of Molecular Sciences. 20, 15, 3638.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › peer review
• 2018

  Characterization of the enhancer and promoter landscape of inflammatory bowel disease from human colon biopsies

  Boyd, M., Thodberg, M., Vitezic, M., Lange, J. B., Vitting-Seerup, K., Chen, Y., Coskun, M., Li, Y., Lo, B. Z. S., Klausen, P., Schweiger, P., Pedersen, A. G., Rapin, N. P. J-P., Skovgaard, K., Dahlgaard, K., Andersson, R., Terkelsen, T. B., Lilje, B., Troelsen, J. T., Petersen, A. M., & 7 flereJensen, K. B., Gögenur, I., Thielsen, P., Seidelin, J. B., Nielsen, O. H., Bjerrum, J. T. & Sandelin, A. G., 1 dec. 2018, I: Nature Communications. 9, 19 s., 1661.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Enhancer 100%
  • Inflammatory Bowel Diseases 79%
  • Colon 67%
  • Biopsy 51%
  • Transcription Initiation Site 48%
  20 Citationer (Scopus)

  120 Downloads (Pure)

• Targeting JAK-STAT signal transduction in IBD

  Soendergaard, C., Bergenheim, F. H., Bjerrum, J. T. & Nielsen, O. H., dec. 2018, I: Pharmacology & Therapeutics. 192, s. 100-111

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Janus Kinases 100%
  • Inflammatory Bowel Diseases 71%
  • Janus Kinase Inhibitors 70%
  • Signal Transduction 59%
  • Drug Compounding 29%
  37 Citationer (Scopus)
• 2015

  Integrative Transcriptomic and Metabonomic Molecular Profiling of Colonic Mucosal Biopsies Indicates a Unique Molecular Phenotype for Ulcerative Colitis

  Rantalainen, M., Bjerrum, J. T., Olsen, J., Nielsen, O. H. & Wang, Y., 2 jan. 2015, I: Journal of Proteome Research. 14, 1, s. 479-90 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Metabolomics 100%
  • Ulcerative Colitis 89%
  • Metabolite 63%
  • Biopsy 55%
  • Phenotype 54%
  5 Citationer (Scopus)
• 2014

  Assessment of the validity of a multigene analysis in the diagnostics of inflammatory bowel disease

  Bjerrum, J. T., Nyberg, C., Olsen, J. & Nielsen, O. H., maj 2014, I: Journal of Internal Medicine. 275, 5, s. 484-93 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Ulcerative Colitis 100%
  • Crohn Disease 96%
  • Inflammatory Bowel Diseases 95%
  • Genes 34%
  • Datasets 26%
  13 Citationer (Scopus)

• Identification of TNF-α-responsive promoters and enhancers in the intestinal epithelial cell model Caco-2

  Boyd, M., Coskun, M., Lilje, B., Andersson, R., Hoof, I., Lange, J. B., Dahlgaard, K., Olsen, J., Vitezic, M., Bjerrum, J. T., Seidelin, J. B., Nielsen, O. H., Troelsen, J. & Sandelin, A. G., 1 dec. 2014, I: D N A Research. 21, 6, s. 569-583 15 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Caco-2 Cells 100%
  • Transcription Initiation Site 65%
  • Epithelial Cells 61%
  • Tumor Necrosis Factor-alpha 60%
  • kalinin 41%
  9 Citationer (Scopus)

  1750 Downloads (Pure)

• Integration of transcriptomics and metabonomics: improving diagnostics, biomarker identification and phenotyping in ulcerative colitis

  Bjerrum, J. T., Rantalainen, M., Wang, Y., Olsen, J. & Nielsen, O. H., apr. 2014, I: Metabolomics. 10, 2, s. 280-290 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Metabolomics 100%
  • Ulcerative Colitis 89%
  • Biological Marker 81%
  • Biomarkers 58%
  • Steroid 27%
  18 Citationer (Scopus)

• Metabonomics of human fecal extracts characterize ulcerative colitis, Crohn's disease and healthy individuals

  Bjerrum, J. T., Wang, Y., Hao, F., Coskun, M., Ludwig, C., Guenther, U. & Nielsen, O. H., feb. 2014, I: Metabolomics. 11, 1, s. 122-133 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Metabolomics 100%
  • Ulcerative Colitis 89%
  • Crohn Disease 86%
  • Metabolome 76%
  • Metabolic 73%
  118 Citationer (Scopus)

• Transcriptional analysis of left-sided colitis, pancolitis, and ulcerative colitis-associated dysplasia

  Bjerrum, J. T., Nielsen, O. H., Riis, L. B., Pittet, V., Mueller, C., Rogler, G. & Olsen, J., 1 dec. 2014, I: Inflammatory Bowel Diseases. 20, 12, s. 2340-2352 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Colitis 100%
  • Ulcerative Colitis 95%
  • Insulin Receptor 19%
  • Protein-Serine-Threonine Kinases 19%
  • Principal Component Analysis 18%
  17 Citationer (Scopus)
• 2013

  Colitis ulcerosa

  Nielsen, O. H., Jess, T., Bjerrum, J. T. & Seidelin, J. B., maj 2013, I: Ugeskrift for Laeger. 175, 20, s. 1412-6 5 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Ulcerative Colitis 100%
  • Sclerosing Cholangitis 42%
  • Inflammatory Bowel Diseases 31%
  • Fatigue 28%
  • Anemia 28%
  2 Citationer (Scopus)

• miR-20b, miR-98, miR-125b-1*, and let-7e* as new potential diagnostic biomarkers in ulcerative colitis

  Coskun, M., Bjerrum, J. T., Seidelin, J. B., Troelsen, J., Olsen, J. & Nielsen, O. H., 21 jul. 2013, I: World Journal of Gastroenterology. 19, 27, s. 4289-99 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Ulcerative Colitis 100%
  • Biomarkers 66%
  • MicroRNAs 64%
  • Crohn Disease 42%
  • Real-Time Polymerase Chain Reaction 15%
  59 Citationer (Scopus)

• Noninfectious & noninflammatory bowel disease colitis

  Nielsen, O. H., Bjerrum, J. T. & Seidelin, J. B., 1 mar. 2013, Advances in the Management of Inflammatory Bowel Disease. Future Medicine Ltd., s. 33-49 17 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

• Recent advances using immunomodulators for inflammatory bowel disease

  Nielsen, O. H., Bjerrum, J. T., Herfarth, H. & Rogler, G., jun. 2013, I: British Journal of Clinical Pharmacology. Supplement. 53, 6, s. 575-588 14 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Immunologic Factors 100%
  • Inflammatory Bowel Diseases 87%
  • Methotrexate 53%
  • Mercaptopurine 49%
  • Azathioprine 41%
  30 Citationer (Scopus)
• 2010

  Genome-wide Gene Expression Analysis of Mucosal Colonic Biopsies and Isolated Colonocytes Suggests a Continuous Inflammatory State in the Lamina Propria of Patients with Quiescent Ulcerative Colitis

  Bidragets oversatte titel: Genome-wide Gene Expression Analysis of Mucosal Colonic Biopsies and Isolated Colonocytes Suggests a Continuous Inflammatory State in the Lamina Propria of Patients with Quiescent Ulcerative ColitisBjerrum, J. T., Hansen, M., Olsen, J., Nielsen, O. H., Bjerrum, J. T., Hansen, M., Olsen, J. & Nielsen, O. H., 2010, I: Inflammatory Bowel Diseases. 16, 6, s. 999-1007 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Ulcerative Colitis 100%
  • Mucous Membrane 81%
  • Genome 68%
  • Biopsy 61%
  • Gene Expression 60%
  25 Citationer (Scopus)

• IL-33 is upregulated in colonocytes of ulcerative colitis

  Seidelin, J. B., Bjerrum, J. T., Coskun, M., Widjaya, B., Vainer, B., Nielsen, O. H., Seidelin, J. B., Bjerrum, J. T., Coskun, M., Widjaya, B., Vainer, B. & Nielsen, O. H., 18 jan. 2010, I: Immunology Letters. 128, 1, s. 80-5 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Interleukin-33 100%
  • Ulcerative Colitis 72%
  • Cytokines 16%
  • Interleukin-1 15%
  • Caspase 1 12%
  110 Citationer (Scopus)

• Metabonomics in Ulcerative Colitis: Diagnostics, Biomarker Identification, And Insight into the Pathophysiology

  Bjerrum, J. T., Nielsen, O. H., Hao, F., Tang, H., Nicholson, J. K., Wang, Y., Olsen, J., Bjerrum, J. T., Nielsen, O. H., Shen, H., Tang, H. R., Nicholson, J. B., Wang, L. & Olsen, J., 5 feb. 2010, I: Journal of Proteome Research. 9, 2, s. 954-962 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Glycerophosphocholine 100%
  • Myo-Inositol 83%
  • Metabolomics 69%
  • Ulcerative Colitis 61%
  • Biological Marker 56%
  118 Citationer (Scopus)

• Transcriptomics, metabonomics, and ulcerative colitis

  Bjerrum, J. T., 2010

  Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling
• 2009

  Diagnosis of ulcerative colitis before onset of inflammation by multivariate modeling of genome-wide gene expression data

  Olsen, J., Gerds, T. A., Seidelin, J. B., Csillag, C., Bjerrum, J. T., Troelsen, J. T. & Nielsen, O. H., 2009, I: Inflammatory Bowel Diseases. 15, 7, s. 1032-8 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Ulcerative Colitis 100%
  • Crohn Disease 69%
  • Genome 68%
  • Biopsy 61%
  • Gene Expression 60%
  71 Citationer (Scopus)

• Influence of smoking on colonic gene expression profile in Crohn's disease

  Nielsen, O. H., Bjerrum, J. T., Csillag, C., Nielsen, F. C. & Olsen, J., 2009, I: PLoS ONE. 4, 7, s. e6210

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Gene Expression Profile 100%
  • Crohn disease 90%
  • Smoking 82%
  • gene expression 69%
  • smoking 66%
  24 Citationer (Scopus)
• 2008

  Technology insight: metabonomics in gastroenterology-basic principles and potential clinical applications.

  Bjerrum, J. T., Nielsen, O. H., Wang, Y. L. & Olsen, J., 2008, I: Nature Clinical Practice Gastroenterology & Hepatology. 5, 6, s. 332-43 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Gastroenterology 100%
  • Metabolomics 98%
  • Technology 58%
  • Magnetic Resonance Spectroscopy 37%
  • Systems Biology 26%
  22 Citationer (Scopus)
• 2007

  Azathioprin og 6-mercaptopurin som vedligeholdelsesbehandling ved colitis ulcerosa: Gennemgang af Cochrane-review

  Bjerrum, J. E. & Nielsen, O. H., 12 okt. 2007, I: Ugeskrift for Laeger. 169, 50, s. 4341-4344 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

• CARD15 status and familial predisposition for Crohn's disease and colonic gene expression

  Csillag, C., Nielsen, O. H., Borup, R., Olsen, J., Bjerrum, J. T. & Nielsen, F. C., 2007, I: Digestive Diseases and Sciences. 52, 8, s. 1783-1789 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  10 Citationer (Scopus)

• TNF-α-antistofbehandling og remissionsinduktion ved colitis ulcerosa: Gennemgang af et Cochrane-review

  Bjerrum, J. T., Munck, L. K., Krogh-Madsen, M. & Nielsen, O. H., 26 feb. 2007, I: Ugeskrift for Laeger. 169, 9, s. 792-795 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review

  1 Citationer (Scopus)
• 2006

  Perioperativ blodtransfusion og recidiv af karcinom i colon og rectum: Gennemgang af et Cochrane-review

  Bjerrum, J. T., Jensen, L. S. & Nielsen, O. H., 21 aug. 2006, I: Ugeskrift for Laeger. 168, 34, 1 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review

  3 Citationer (Scopus)