Forskningsdatasæt
Søgeresultater
-
Additional file 2 of A comprehensive map of human glucokinase variant activity
Gersing, S. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Gebbia, M. (Ophavsmand), Gjesing, A. P. (Ophavsmand), Coté, A. G. (Ophavsmand), Seesankar, G. (Ophavsmand), Li, R. (Ophavsmand), Tabet, D. (Ophavsmand), Weile, J. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Gloyn, A. L. (Ophavsmand), Hansen, T. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2023
DOI: 10.6084/m9.figshare.22705955, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_A_comprehensive_map_of_human_glucokinase_variant_activity/22705955
Datasæt
-
NMR data for titration of various mutants in a highly charge depleted protein EXG:CBM
Winther, J. R. (Ophavsmand), Højgaard, C. (Ophavsmand) & Teilum, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2020
DOI: 10.5281/zenodo.3979153, https://zenodo.org/record/3979153
Datasæt
-
CG model of liquid-liquid phase behaviour of IDPs
Tesei, G. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Crehuet, R. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2021
DOI: 10.5281/zenodo.5828163, https://zenodo.org/records/5828163
Datasæt
-
A comprehensive map of human glucokinase variant activity
Gersing, S. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Gebbia, M. (Ophavsmand), Gjesing, A. P. (Ophavsmand), Coté, A. G. (Ophavsmand), Seesankar, G. (Ophavsmand), Li, R. (Ophavsmand), Tabet, D. (Ophavsmand), Weile, J. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Gloyn, A. L. (Ophavsmand), Hansen, T. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2023
DOI: 10.6084/m9.figshare.c.6619076, https://springernature.figshare.com/collections/A_comprehensive_map_of_human_glucokinase_variant_activity/6619076
Datasæt
-
Plumed files for 'Molecular simulations capture the transient exposure of a buried phosphorylation site in the autoinhibited state of a protein'
Orioli, S. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2021
DOI: 10.5281/zenodo.4733551, https://zenodo.org/record/4733551
Datasæt
-
A coarse-grained model for disordered and multi-domain proteins
Cao, F. (Ophavsmand), Bülow, S. V. (Ophavsmand), Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 16 okt. 2024
DOI: 10.5281/zenodo.14276086, https://zenodo.org/records/14276086
Datasæt
-
CALVADOS: Coarse-graining Approach to Liquid-liquid phase separation Via an Automated Data-driven Optimisation Scheme
Tesei, G. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Crehuet, R. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 12 sep. 2024
DOI: 10.5281/zenodo.13754000, https://zenodo.org/records/13754000
Datasæt
-
Characterizing glucokinase variant mechanisms using a multiplexed abundance assay
Gersing, S. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2024
DOI: 10.6084/m9.figshare.c.7185485.v1, https://springernature.figshare.com/collections/Characterizing_glucokinase_variant_mechanisms_using_a_multiplexed_abundance_assay/7185485/1
Datasæt
-
Characterizing glucokinase variant mechanisms using a multiplexed abundance assay
Gersing, S. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2024
DOI: 10.6084/m9.figshare.c.7185485, https://springernature.figshare.com/collections/Characterizing_glucokinase_variant_mechanisms_using_a_multiplexed_abundance_assay/7185485
Datasæt
-
FRETpredict
Montepietra, D. (Ophavsmand), Tesei, G. (Ophavsmand), Martins, J. M. (Ophavsmand), Kunze, M. B. A. (Ophavsmand), Best, R. B. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2023
DOI: 10.5281/zenodo.10371378, https://zenodo.org10371378
Datasæt
-
A comprehensive map of human glucokinase variant activity
Gersing, S. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Gebbia, M. (Ophavsmand), Gjesing, A. P. (Ophavsmand), Coté, A. G. (Ophavsmand), Seesankar, G. (Ophavsmand), Li, R. (Ophavsmand), Tabet, D. (Ophavsmand), Weile, J. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Gloyn, A. L. (Ophavsmand), Hansen, T. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2023
DOI: 10.6084/m9.figshare.c.6619076.v1, https://springernature.figshare.com/collections/A_comprehensive_map_of_human_glucokinase_variant_activity/6619076/1
Datasæt
-
Additional file 2 of A comprehensive map of human glucokinase variant activity
Gersing, S. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Gebbia, M. (Ophavsmand), Gjesing, A. P. (Ophavsmand), Coté, A. G. (Ophavsmand), Seesankar, G. (Ophavsmand), Li, R. (Ophavsmand), Tabet, D. (Ophavsmand), Weile, J. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Gloyn, A. L. (Ophavsmand), Hansen, T. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2023
DOI: 10.6084/m9.figshare.22705955.v1, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_A_comprehensive_map_of_human_glucokinase_variant_activity/22705955/1
Datasæt
-
Molecular simulations and pre-analyzed data for 'Molecular simulations capture the transient exposure of a buried phosphorylation site in the autoinhibited state of a protein'
Orioli, S. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2021
DOI: 10.5281/zenodo.4719711, https://zenodo.org/record/4719711
Datasæt
-
CALVADOS: Coarse-graining Approach to Liquid-liquid phase separation Via an Automated Data-driven Optimisation Scheme
Tesei, G. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Crehuet, R. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2022
DOI: 10.5281/zenodo.6914054, https://zenodo.org/records/6914054
Datasæt
-
Improved Predictions of Phase Behaviour of IDPs by Tuning the Interaction Range
Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2022
DOI: 10.5281/zenodo.6901205, https://zenodo.org/record/6901205
Datasæt
-
Molecular simulations of the N-terminal domain of CPEB4
Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2023
DOI: 10.5281/zenodo.7727848, https://zenodo.org/record/7727848
Datasæt
-
A coarse-grained model for disordered and multi-domain proteins
Cao, F. (Ophavsmand), Bülow, S. V. (Ophavsmand), Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 5 dec. 2024
DOI: 10.5281/zenodo.14282804, https://zenodo.org/records/14282804
Datasæt
-
The mechanism of amyloid fibril growth from Φ-value analysis - data and analysis repository
Buell, A. (Ophavsmand), Larsen, J. A. (Bidrager), Barclay, A. (Bidrager), Vettore, N. (Bidrager), Klausen, L. K. (Bidrager), Mangels, L. (Bidrager), Coden, A. (Bidrager), Schmit, J. D. (Bidrager), Lindorff-Larsen, K. (Bidrager) & Buell, A. K. (Bidrager), Zenodo, 22 nov. 2024
DOI: 10.5281/zenodo.14204396, https://zenodo.org/records/14204396
Datasæt
-
Molecular simulations of the N-terminal domain of CPEB4
Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 4 sep. 2024
DOI: 10.5281/zenodo.13684962, https://zenodo.org/records/13684962
Datasæt
-
Supporting data for transmembrane domain self association simulations in "Recalibration of protein interactions in Martini 3"
Thomasen, F. E. (Ophavsmand), Skaalum, T. (Ophavsmand), Kumar, A. (Ophavsmand), Srinivasan, S. (Ophavsmand), Vanni, S. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 9 apr. 2024
DOI: 10.5281/zenodo.10949496, https://zenodo.org/records/10949496
Datasæt
-
Additional file 2 of Characterizing glucokinase variant mechanisms using a multiplexed abundance assay
Gersing, S. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2024
DOI: 10.6084/m9.figshare.26707496, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_Characterizing_glucokinase_variant_mechanisms_using_a_multiplexed_abundance_assay/26707496
Datasæt
-
Trajectories from "A glutamine-based single ɑ-helix scaffold to target globular proteins" Escobedo et al. 2022
Escobedo, A. (Ophavsmand), Piccirillo, J. (Ophavsmand), Aranda, J. (Ophavsmand), Diercks, T. (Ophavsmand), Mateos, B. (Ophavsmand), Garcia-Cabau, C. (Ophavsmand), Sánchez-Navarro, M. (Ophavsmand), Topal, B. (Ophavsmand), Biesaga, M. (Ophavsmand), Staby, L. (Ophavsmand), Kragelund, B. (Ophavsmand), García, J. (Ophavsmand), Millet, O. (Ophavsmand), Orozco, M. (Ophavsmand), Coles, M. (Ophavsmand), Crehuet, R. (Ophavsmand) & Salvatella, X. (Ophavsmand), Zenodo, 2022
DOI: 10.5281/zenodo.7270329, https://zenodo.org/records/7270329
Datasæt
-
3x 1 µs all-atom MD trajectories; AMBER ff15ipq & SPC/Eb; T4 Lysozyme; 'Fitting side-chain NMR relaxation data using molecular simulations'
Kümmerer, F. (Ophavsmand), Orioli, S. (Ophavsmand), Harding-Larsen, D. (Ophavsmand), Hoffmann, F. (Ophavsmand), Gavrilov, Y. (Ophavsmand), Teilum, K. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2020
DOI: 10.5281/zenodo.3991429, https://zenodo.org/record/3991429
Datasæt
-
5x 1 µs all-atom MD trajectories; AMBER ff99SB*-ILDN & TIP4P/2005; T4 Lysozyme; 'Fitting side-chain NMR relaxation data using molecular simulations'
Kümmerer, F. (Ophavsmand), Orioli, S. (Ophavsmand), Harding-Larsen, D. (Ophavsmand), Hoffmann, F. (Ophavsmand), Gavrilov, Y. (Ophavsmand), Teilum, K. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2020
DOI: 10.5281/zenodo.3989057, https://zenodo.org/record/3989057
Datasæt