Forskningsdatasæt
Søgeresultater
-
Molecular simulations of the N-terminal domain of CPEB4
Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2023
DOI: 10.5281/zenodo.7727848, https://zenodo.org/record/7727848
Datasæt
-
Molecular simulations of the N-terminal domain of CPEB4
Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2023
DOI: 10.5281/zenodo.7749344, https://zenodo.org/records/7749344
Datasæt
-
Conformational ensembles of the human IDRome
Tesei, G. (Ophavsmand), Trolle, A. I. (Ophavsmand), Jonsson, N. (Ophavsmand), Betz, J. (Ophavsmand), Knudsen, F. E. (Ophavsmand), Pesce, F. (Ophavsmand), Johansson, K. E. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2023
DOI: 10.5281/zenodo.10251736, https://zenodo.org/records/10251736
Datasæt
-
3x 1 µs all-atom MD trajectories; AMBER ff15ipq & SPC/Eb; T4 Lysozyme; 'Fitting side-chain NMR relaxation data using molecular simulations'
Kümmerer, F. (Ophavsmand), Orioli, S. (Ophavsmand), Harding-Larsen, D. (Ophavsmand), Hoffmann, F. (Ophavsmand), Gavrilov, Y. (Ophavsmand), Teilum, K. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2020
DOI: 10.5281/zenodo.3991429, https://zenodo.org/record/3991429
Datasæt
-
FRETpredict
Montepietra, D. (Ophavsmand), Tesei, G. (Ophavsmand), Martins, J. M. (Ophavsmand), Kunze, M. B. A. (Ophavsmand), Best, R. B. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2023
DOI: 10.5281/zenodo.10371378, https://zenodo.org10371378
Datasæt
-
Data analyses using FRETpredict
Montepietra, D. (Ophavsmand), Tesei, G. (Ophavsmand), Best, R. B. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2024
DOI: 10.5281/zenodo.10573638, https://zenodo.org/records/10573638
Datasæt
-
Molecular simulations of the N-terminal domain of CPEB4
Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2024
DOI: 10.5281/zenodo.13684962, https://zenodo.org/records/13684962
Datasæt
-
Additional file 2 of A comprehensive map of human glucokinase variant activity
Gersing, S. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Gebbia, M. (Ophavsmand), Gjesing, A. P. (Ophavsmand), Coté, A. G. (Ophavsmand), Seesankar, G. (Ophavsmand), Li, R. (Ophavsmand), Tabet, D. (Ophavsmand), Weile, J. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Gloyn, A. L. (Ophavsmand), Hansen, T. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2023
DOI: 10.6084/m9.figshare.22705955, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_A_comprehensive_map_of_human_glucokinase_variant_activity/22705955
Datasæt
-
The mechanism of amyloid fibril growth from Φ-value analysis - data and analysis repository
Buell, A. (Ophavsmand), Larsen, J. A. (Bidrager), Barclay, A. (Bidrager), Vettore, N. (Bidrager), Klausen, L. K. (Bidrager), Mangels, L. (Bidrager), Coden, A. (Bidrager), Schmit, J. D. (Bidrager), Lindorff-Larsen, K. (Bidrager) & Buell, A. K. (Bidrager), Zenodo, 2024
DOI: 10.5281/zenodo.11191318, https://zenodo.org/records/11191318
Datasæt
-
Characterizing glucokinase variant mechanisms using a multiplexed abundance assay
Gersing, S. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2024
DOI: 10.6084/m9.figshare.c.7185485.v1, https://springernature.figshare.com/collections/Characterizing_glucokinase_variant_mechanisms_using_a_multiplexed_abundance_assay/7185485/1
Datasæt
-
Characterizing glucokinase variant mechanisms using a multiplexed abundance assay
Gersing, S. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2024
DOI: 10.6084/m9.figshare.c.7185485, https://springernature.figshare.com/collections/Characterizing_glucokinase_variant_mechanisms_using_a_multiplexed_abundance_assay/7185485
Datasæt
-
Improved Predictions of Phase Behaviour of IDPs by Tuning the Interaction Range
Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2022
DOI: 10.5281/zenodo.6815068, https://zenodo.org/record/6815068
Datasæt
-
Trajectories from "A glutamine-based single ɑ-helix scaffold to target globular proteins" Escobedo et al. 2022
Escobedo, A. (Ophavsmand), Piccirillo, J. (Ophavsmand), Aranda, J. (Ophavsmand), Diercks, T. (Ophavsmand), Mateos, B. (Ophavsmand), Garcia-Cabau, C. (Ophavsmand), Sánchez-Navarro, M. (Ophavsmand), Topal, B. (Ophavsmand), Biesaga, M. (Ophavsmand), Staby, L. (Ophavsmand), Kragelund, B. B. (Ophavsmand), García, J. (Ophavsmand), Millet, O. (Ophavsmand), Orozco, M. (Ophavsmand), Coles, M. (Ophavsmand), Crehuet, R. (Ophavsmand) & Salvatella, X. (Ophavsmand), Zenodo, 2022
DOI: 10.5281/zenodo.7270329, https://zenodo.org/records/7270329
Datasæt
-
Improved Predictions of Phase Behaviour of IDPs by Tuning the Interaction Range
Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2022
DOI: 10.5281/zenodo.6901205, https://zenodo.org/record/6901205
Datasæt
-
Supporting data for "Recalibration of protein interactions in Martini 3"
Thomasen, F. E. (Ophavsmand), Skaalum, T. (Ophavsmand), Kumar, A. (Ophavsmand), Srinivasan, S. (Ophavsmand), Vanni, S. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2023
DOI: 10.5281/zenodo.8010043, https://zenodo.org/records/8010043
Datasæt
-
Rotamer distributions and spectral densities for 'Fitting side-chain NMR relaxation data using molecular simulations'
Kümmerer, F. (Ophavsmand), Orioli, S. (Ophavsmand), Harding-Larsen, D. (Ophavsmand), Hoffmann, F. (Ophavsmand), Gavrilov, Y. (Ophavsmand), Teilum, K. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2020
DOI: 10.5281/zenodo.3987818, https://zenodo.org/record/3987818
Datasæt
-
5x 1 µs all-atom MD trajectories; AMBER ff99SB*-ILDN & TIP4P/2005; T4 Lysozyme; 'Fitting side-chain NMR relaxation data using molecular simulations'
Kümmerer, F. (Ophavsmand), Orioli, S. (Ophavsmand), Harding-Larsen, D. (Ophavsmand), Hoffmann, F. (Ophavsmand), Gavrilov, Y. (Ophavsmand), Teilum, K. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2020
DOI: 10.5281/zenodo.3989057, https://zenodo.org/record/3989057
Datasæt
-
3x 5 µs all-atom MD trajectories; AMBER ff99SB*-ILDN & TIP4P/2005; T4 Lysozyme; 'Fitting side-chain NMR relaxation data using molecular simulations'
Kümmerer, F. (Ophavsmand), Orioli, S. (Ophavsmand), Harding-Larsen, D. (Ophavsmand), Hoffmann, F. (Ophavsmand), Gavrilov, Y. (Ophavsmand), Teilum, K. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2020
DOI: 10.5281/zenodo.3989044, https://zenodo.org/record/3989044
Datasæt
-
Improved Predictions of Phase Behaviour of IDPs by Tuning the Interaction Range
Tesei, G. (Ophavsmand) & Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand), Zenodo, 2022
DOI: 10.5281/zenodo.7437501, https://zenodo.org/records/7437501
Datasæt
-
A comprehensive map of human glucokinase variant activity
Gersing, S. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Gebbia, M. (Ophavsmand), Gjesing, A. P. (Ophavsmand), Coté, A. G. (Ophavsmand), Seesankar, G. (Ophavsmand), Li, R. (Ophavsmand), Tabet, D. (Ophavsmand), Weile, J. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Gloyn, A. L. (Ophavsmand), Hansen, T. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2023
DOI: 10.6084/m9.figshare.c.6619076, https://springernature.figshare.com/collections/A_comprehensive_map_of_human_glucokinase_variant_activity/6619076
Datasæt
-
Additional file 2 of Characterizing glucokinase variant mechanisms using a multiplexed abundance assay
Gersing, S. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2024
DOI: 10.6084/m9.figshare.26707496.v1, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_Characterizing_glucokinase_variant_mechanisms_using_a_multiplexed_abundance_assay/26707496/1
Datasæt
-
-
Additional file 2 of Characterizing glucokinase variant mechanisms using a multiplexed abundance assay
Gersing, S. (Ophavsmand), Schulze, T. K. (Ophavsmand), Cagiada, M. (Ophavsmand), Stein, A. (Ophavsmand), Roth, F. P. (Ophavsmand), Lindorff-Larsen, K. (Ophavsmand) & Hartmann-Petersen, R. (Ophavsmand), figshare, 2024
DOI: 10.6084/m9.figshare.26707496, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_Characterizing_glucokinase_variant_mechanisms_using_a_multiplexed_abundance_assay/26707496
Datasæt