Abstract
Approaches exploiting trait distribution extremes may be used to identify loci associated with common traits, but it is unknown whether these loci are generalizable to the broader population. In a genome-wide search for loci associated with the upper versus the lower 5th percentiles of body mass index, height and waist-to-hip ratio, as well as clinical classes of obesity, including up to 263,407 individuals of European ancestry, we identified 4 new loci (IGFBP4, H6PD, RSRC1 and PPP2R2A) influencing height detected in the distribution tails and 7 new loci (HNF4G, RPTOR, GNAT2, MRPS33P4, ADCY9, HS6ST3 and ZZZ3) for clinical classes of obesity. Further, we find a large overlap in genetic structure and the distribution of variants between traits based on extremes and the general population and little etiological heterogeneity between obesity subgroups.
| Bidragets oversatte titel | Genome-wide meta-analysis identifies 11 new loci for anthropometric traits and provides insights into genetic architecture |
|---|---|
| Originalsprog | Engelsk |
| Tidsskrift | Nature Genetics |
| Vol/bind | 45 |
| Udgave nummer | 5 |
| Sider (fra-til) | 501-512 |
| Antal sider | 12 |
| ISSN | 1061-4036 |
| DOI | |
| Status | Udgivet - maj 2013 |
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Genome-wide meta-analysis identifies 11 new loci for anthropometric traits and provides insights into genetic architecture. / Berndt, Sonja I; Gustafsson, Stefan; Mägi, Reedik et al.
I: Nature Genetics, Bind 45, Nr. 5, 05.2013, s. 501-512.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
}
TY - JOUR
T1 - Genome-wide meta-analysis identifies 11 new loci for anthropometric traits and provides insights into genetic architecture
AU - Berndt, Sonja I
AU - Gustafsson, Stefan
AU - Mägi, Reedik
AU - Ganna, Andrea
AU - Wheeler, Eleanor
AU - Feitosa, Mary F
AU - Justice, Anne E
AU - Monda, Keri L
AU - Croteau-Chonka, Damien C
AU - Day, Felix R
AU - Esko, Tõnu
AU - Fall, Tove
AU - Ferreira, Teresa
AU - Gentilini, Davide
AU - Jackson, Anne U
AU - Luan, Jian'an
AU - Randall, Joshua C
AU - Vedantam, Sailaja
AU - Willer, Cristen J
AU - Winkler, Thomas
AU - Wood, Andrew R
AU - Workalemahu, Tsegaselassie
AU - Hu, Yi-Juan
AU - Lee, Sang Hong
AU - Liang, Liming
AU - Lin, Dan-Yu
AU - Min, Josine L
AU - Neale, Benjamin M
AU - Thorleifsson, Gudmar
AU - Yang, Jian
AU - Albrecht, Eva
AU - Amin, Najaf
AU - Bragg-Gresham, Jennifer L
AU - Cadby, Gemma
AU - den Heijer, Martin
AU - Eklund, Niina
AU - Fischer, Krista
AU - Goel, Anuj
AU - Hottenga, Jouke-Jan
AU - Huffman, Jennifer E
AU - Jarick, Ivonne
AU - Johansson, Åsa
AU - Johnson, Toby
AU - Kanoni, Stavroula
AU - Kleber, Marcus E
AU - König, Inke R
AU - Kristiansson, Kati
AU - Kutalik, Zoltán
AU - Lamina, Claudia
AU - Lecoeur, Cecile
AU - Li, Guo
AU - Mangino, Massimo
AU - McArdle, Wendy L
AU - Medina-Gomez, Carolina
AU - Müller-Nurasyid, Martina
AU - Ngwa, Julius S
AU - Nolte, Ilja M
AU - Paternoster, Lavinia
AU - Pechlivanis, Sonali
AU - Perola, Markus
AU - Peters, Marjolein J
AU - Preuss, Michael
AU - Rose, Lynda M
AU - Shi, Jianxin
AU - Shungin, Dmitry
AU - Smith, Albert Vernon
AU - Strawbridge, Rona J
AU - Surakka, Ida
AU - Teumer, Alexander
AU - Trip, Mieke D
AU - Tyrer, Jonathan
AU - Van Vliet-Ostaptchouk, Jana V
AU - Vandenput, Liesbeth
AU - Waite, Lindsay L
AU - Zhao, Jing Hua
AU - Absher, Devin
AU - Asselbergs, Folkert W
AU - Atalay, Mustafa
AU - Attwood, Antony P
AU - Balmforth, Anthony J
AU - Basart, Hanneke
AU - Beilby, John
AU - Bonnycastle, Lori L
AU - Brambilla, Paolo
AU - Bruinenberg, Marcel
AU - Campbell, Harry
AU - Chasman, Daniel I
AU - Chines, Peter S
AU - Collins, Francis S
AU - Connell, John M
AU - Cookson, William O
AU - de Faire, Ulf
AU - de Vegt, Femmie
AU - Dei, Mariano
AU - Dimitriou, Maria
AU - Edkins, Sarah
AU - Estrada, Karol
AU - Evans, David M
AU - Farrall, Martin
AU - Ferrario, Marco M
AU - Ferrières, Jean
AU - Franke, Lude
AU - Frau, Francesca
AU - Gejman, Pablo V
AU - Grallert, Harald
AU - Grönberg, Henrik
AU - Gudnason, Vilmundur
AU - Hall, Alistair S
AU - Hall, Per
AU - Hartikainen, Anna-Liisa
AU - Hayward, Caroline
AU - Heard-Costa, Nancy L
AU - Heath, Andrew C
AU - Hebebrand, Johannes
AU - Homuth, Georg
AU - Hu, Frank B
AU - Hunt, Sarah E
AU - Hyppönen, Elina
AU - Iribarren, Carlos
AU - Jacobs, Kevin B
AU - Jansson, John-Olov
AU - Jula, Antti
AU - Kähönen, Mika
AU - Kathiresan, Sekar
AU - Kee, Frank
AU - Khaw, Kay-Tee
AU - Kivimäki, Mika
AU - Koenig, Wolfgang
AU - Kraja, Aldi T
AU - Kumari, Meena
AU - Kuulasmaa, Kari
AU - Kuusisto, Johanna
AU - Laitinen, Jaana H
AU - Lakka, Timo A
AU - Langenberg, Claudia
AU - Launer, Lenore J
AU - Lind, Lars
AU - Lindström, Jaana
AU - Liu, Jianjun
AU - Liuzzi, Antonio
AU - Lokki, Marja-Liisa
AU - Lorentzon, Mattias
AU - Madden, Pamela A
AU - Magnusson, Patrik K
AU - Manunta, Paolo
AU - Marek, Diana
AU - März, Winfried
AU - Mateo Leach, Irene
AU - McKnight, Barbara
AU - Medland, Sarah E
AU - Mihailov, Evelin
AU - Milani, Lili
AU - Montgomery, Grant W
AU - Mooser, Vincent
AU - Mühleisen, Thomas W
AU - Munroe, Patricia B
AU - Musk, Arthur W
AU - Narisu, Narisu
AU - Navis, Gerjan
AU - Nicholson, George
AU - Nohr, Ellen A
AU - Ong, Ken K
AU - Oostra, Ben A
AU - Palmer, Colin N A
AU - Palotie, Aarno
AU - Peden, John F
AU - Pedersen, Nancy
AU - Peters, Annette
AU - Polasek, Ozren
AU - Pouta, Anneli
AU - Pramstaller, Peter P
AU - Prokopenko, Inga
AU - Pütter, Carolin
AU - Radhakrishnan, Aparna
AU - Raitakari, Olli
AU - Rendon, Augusto
AU - Rivadeneira, Fernando
AU - Rudan, Igor
AU - Saaristo, Timo E
AU - Sambrook, Jennifer G
AU - Sanders, Alan R
AU - Sanna, Serena
AU - Saramies, Jouko
AU - Schipf, Sabine
AU - Schreiber, Stefan
AU - Schunkert, Heribert
AU - Shin, So-Youn
AU - Signorini, Stefano
AU - Sinisalo, Juha
AU - Skrobek, Boris
AU - Soranzo, Nicole
AU - Stan?áková, Alena
AU - Stark, Klaus
AU - Stephens, Jonathan C
AU - Stirrups, Kathleen
AU - Stolk, Ronald P
AU - Stumvoll, Michael
AU - Swift, Amy J
AU - Theodoraki, Eirini V
AU - Thorand, Barbara
AU - Tregouet, David-Alexandre
AU - Tremoli, Elena
AU - Van der Klauw, Melanie M
AU - van Meurs, Joyce B J
AU - Vermeulen, Sita H
AU - Viikari, Jorma
AU - Virtamo, Jarmo
AU - Vitart, Veronique
AU - Waeber, Gérard
AU - Wang, Zhaoming
AU - Widén, Elisabeth
AU - Wild, Sarah H
AU - Willemsen, Gonneke
AU - Winkelmann, Bernhard R
AU - Witteman, Jacqueline C M
AU - Wolffenbuttel, Bruce H R
AU - Wong, Andrew
AU - Wright, Alan F
AU - Zillikens, M Carola
AU - Amouyel, Philippe
AU - Boehm, Bernhard O
AU - Boerwinkle, Eric
AU - Boomsma, Dorret I
AU - Caulfield, Mark J
AU - Chanock, Stephen J
AU - Cupples, L Adrienne
AU - Cusi, Daniele
AU - Dedoussis, George V
AU - Erdmann, Jeanette
AU - Eriksson, Johan G
AU - Franks, Paul W
AU - Froguel, Philippe
AU - Gieger, Christian
AU - Gyllensten, Ulf
AU - Hamsten, Anders
AU - Harris, Tamara B
AU - Hengstenberg, Christian
AU - Hicks, Andrew A
AU - Hingorani, Aroon
AU - Hinney, Anke
AU - Hofman, Albert
AU - Hovingh, Kees G
AU - Hveem, Kristian
AU - Illig, Thomas
AU - Jarvelin, Marjo-Riitta
AU - Jöckel, Karl-Heinz
AU - Keinanen-Kiukaanniemi, Sirkka M
AU - Kiemeney, Lambertus A
AU - Kuh, Diana
AU - Laakso, Markku
AU - Lehtimäki, Terho
AU - Levinson, Douglas F
AU - Martin, Nicholas G
AU - Metspalu, Andres
AU - Morris, Andrew D
AU - Nieminen, Markku S
AU - Njølstad, Inger
AU - Ohlsson, Claes
AU - Oldehinkel, Albertine J
AU - Ouwehand, Willem H
AU - Palmer, Lyle J
AU - Penninx, Brenda
AU - Power, Chris
AU - Province, Michael A
AU - Psaty, Bruce M
AU - Qi, Lu
AU - Rauramaa, Rainer
AU - Ridker, Paul M
AU - Ripatti, Samuli
AU - Salomaa, Veikko
AU - Samani, Nilesh J
AU - Snieder, Harold
AU - Sørensen, Thorkild I A
AU - Spector, Timothy D
AU - Stefansson, Kari
AU - Tönjes, Anke
AU - Tuomilehto, Jaakko
AU - Uitterlinden, André G
AU - Uusitupa, Matti
AU - van der Harst, Pim
AU - Vollenweider, Peter
AU - Wallaschofski, Henri
AU - Wareham, Nicholas J
AU - Watkins, Hugh
AU - Wichmann, H-Erich
AU - Wilson, James
AU - Abecasis, Goncalo R
AU - Assimes, Themistocles L
AU - Barroso, Inês
AU - Boehnke, Michael
AU - Borecki, Ingrid B
AU - Deloukas, Panos
AU - Fox, Caroline S
AU - Frayling, Timothy
AU - Groop, Leif C
AU - Haritunian, Talin
AU - Heid, Iris M
AU - Hunter, David
AU - Kaplan, Robert C
AU - Karpe, Fredrik
AU - Moffatt, Miriam F
AU - Mohlke, Karen L
AU - O'Connell, Jeffrey R
AU - Pawitan, Yudi
AU - Schadt, Eric E
AU - Schlessinger, David
AU - Steinthorsdottir, Valgerdur
AU - Strachan, David P
AU - Thorsteinsdottir, Unnur
AU - van Duijn, Cornelia M
AU - Visscher, Peter M
AU - Di Blasio, Anna Maria
AU - Hirschhorn, Joel N
AU - Lindgren, Cecilia M
AU - Morris, Andrew P
AU - Meyre, David
AU - Scherag, André
AU - McCarthy, Mark I
AU - Speliotes, Elizabeth K
AU - North, Kari E
AU - Loos, Ruth J F
AU - Ingelsson, Erik
PY - 2013/5
Y1 - 2013/5
N2 - Approaches exploiting trait distribution extremes may be used to identify loci associated with common traits, but it is unknown whether these loci are generalizable to the broader population. In a genome-wide search for loci associated with the upper versus the lower 5th percentiles of body mass index, height and waist-to-hip ratio, as well as clinical classes of obesity, including up to 263,407 individuals of European ancestry, we identified 4 new loci (IGFBP4, H6PD, RSRC1 and PPP2R2A) influencing height detected in the distribution tails and 7 new loci (HNF4G, RPTOR, GNAT2, MRPS33P4, ADCY9, HS6ST3 and ZZZ3) for clinical classes of obesity. Further, we find a large overlap in genetic structure and the distribution of variants between traits based on extremes and the general population and little etiological heterogeneity between obesity subgroups.
AB - Approaches exploiting trait distribution extremes may be used to identify loci associated with common traits, but it is unknown whether these loci are generalizable to the broader population. In a genome-wide search for loci associated with the upper versus the lower 5th percentiles of body mass index, height and waist-to-hip ratio, as well as clinical classes of obesity, including up to 263,407 individuals of European ancestry, we identified 4 new loci (IGFBP4, H6PD, RSRC1 and PPP2R2A) influencing height detected in the distribution tails and 7 new loci (HNF4G, RPTOR, GNAT2, MRPS33P4, ADCY9, HS6ST3 and ZZZ3) for clinical classes of obesity. Further, we find a large overlap in genetic structure and the distribution of variants between traits based on extremes and the general population and little etiological heterogeneity between obesity subgroups.
U2 - 10.1038/ng.2606
DO - 10.1038/ng.2606
M3 - Journal article
C2 - 23563607
SN - 1061-4036
VL - 45
SP - 501
EP - 512
JO - Nature: New biology
JF - Nature: New biology
IS - 5
ER -